Avsnitt 1: Allmän kemi och cellen

Vad definierar liv och celler? Ange sex svar!

1. Visar viss grad av organisation

2. Utnyttjar energi för tillväxt och för att hålla igång organisationen.

3. Reproducerar sig.

4. Reagerar på omgivning.

5. Växer och utvecklas enligt ett visst genetiskt mönster.

6. Genomgår evolution.

Kännetecken för celler enligt det centrala dogmat?

1. Alla celler använder DNA som genetisk kod

2. Alla celler replikerar DNA

3. Alla celler transkriberar DNA till RNA

4. Alla celler translaterar RNA till proteiner

5. Alla celler behöver fri energi

6. Alla celler fungerar som biokemiska fabriker

7. Alla celler omsluts av ett plasma membran

Genom vilka alfabet kodas genetisk information i DNA respektive RNA?

RNA: A,C,G och U

DNA: A,C,G och T

Plasmamembranets funktion?

Plasma membranet omsluter celler och de flesta organeller. Det består av ett dubbelt

lipdlager som tillåter vissa joner att passera medan vissa behöver hjälp av speciella

transportproteiner. På plasma membranets utsida sitter det olika sorter av proteiner med

påkopplade kolhydrater som känner av utsidan och signalerar till insidan.

Vad är ett kodon?

Tre stycken nukleotider som kodar för ett protein i mRNA.

Hur byggs proteiner kortfattat upp? Hur läses RNA av?

Ribosomerna läser av ett kodon i taget på mRNA och ett komplementärt tRNA kopplar ihop proteinerna som kodonen kodar för.

Berätta om de tre indelningarna i Kingdoms of life samt vad som är speciellt för de?

De tre delarna är Eukaryoter, Bakterier och Arkéer. Eukaryoter har en cellkärna och organeller vilket gör att denna kategori skiljer sig från de övriga. Skillnaden mellan bakterier och arkeer är genetisk, dessutom har arkeer en eterbindning i lipiderna istället för en esterbindning som bakterier har. Dessa två kategorier har även flageller. En stor skillnad är dock att arkeer finns i extrema miljöer som varken eukaryota- och prokaryota celler kan leva i.

Definitionen av organeller och vilka definitionsproblem som existerar?

Har varit olika i olika tider, nuförtiden måste en organell vara membranomsluten men tex. ribosomer räknas som organeller trots att de inte är membranomslutna. Det vill säga att det skapar ett gränsdragningsproblem huruvida tidigare definierade organeller är organeller eller inte.

Hur fungerar endocytos och exocytos? Vilka organeller ingår?

Ämnen tas upp/släpps ut mha vesiklar, dessa transporterar ämnen mellan golgi, endosomer, ER/lysosomer både extracellulärt och cellulärt beroende på vart ämnena ska. Endocytos är när cellen tar upp molekyler genom cellmembranet, och endocytos är när molekyler släpps ut genom cellmembranet.

Hur är cellkärnan uppbyggd och vad innehåller den?

Dubbelt membran (Outer nuclearmembrane och inner nuclearmembrane), perinuclearspace, DNA, nukleol där ribosomer bildas, nuclearpores, nuclear lamina, ER membrane och ER lumen. Innehåller genetiskt material, DNA. Den fungerar som cellens kontrollcenter då den bestämmer vilka proteiner som ska bildas.

Vad sker i ER? Vilka typer finns det och vad är skillnaden mellan dessa?

I rER sker proteinsyntesen medan fettproduktion äger rum i sER. Här produceras och transporteras proteiner och proteiner kan även börja modifieras här innan de skickas till golgi. Är alltså ett veckat nätverk som producerar och transporterar proteiner och lipider.

- Rough ER: Täckta av ribosomer. Här sker proteinsyntesen, dvs translationen av RNA till

proteiner.

- Smooth ER: Inga ribosomer. Här sker lipidsyntes.

Vilken funktion har Golgi?

ER till Golgi. Vesiklar åker från ER till golgi för modifiering, tex. påkoppling av en kohydrat till

ett protein. Här sorteras och transporteras även molekyler, poststation. Det vill säga om de ska ur cellen med exocytos eller om de ska till någon av cellens organeller.

Vilken funktion har peroxisomer?

I peroxisomer finns det oxidativa enzymer, dvs enzymer som oxiderar molekyler. Här sker

nedbrytning av långa fettsyror aha syrgas som genererar väteperoxid. Även detoxifiering av alkoholer. Väteperoxid bryts sedan ner av Katalas.

Vilken funktion har Endosomer/ Lysosomer?

Sorterar upptagna molekyler: tar emot, sorterar, bryter ned. Lysosomen möjliggör

användning av ned nedbrutna molekylens beståndsdelar.

- Surt pH - underlättar nedbrytning

Early endosome till late endosome till endolysosome till lysosome.

Vad innebär glykolysering och vilka organeller deltar?

N-glykolisering sker i ER där aminogrupper NH2 adderas och bildar glykoproteiner (dessa är ofta extracellulära). O-glykolisering sker i golgi och där adderas OH-grupper vilket bildar proteoglykaner (ofta extracellulära).

Förklara Adhesioner?

En mängd proteiner som bildar ett komplex som fäster på membranytan. Fäster ihop celler på olika sätt:

Tight junctions, som är en typ av adhesion, kopplar ihop celler så att ämnen inte färdas mellan cellerna istället för igenom.

Desmosomes är en annan adhesion som kopplar ihop celler och håller de stabila, cytoskelettet binder mellan desmosomes.

Förklara extracellulär matrix?

Extracellulär matrix är den substans som finns mellan cellerna och omkring cellerna förutom de celler som transporteras i blodet. Det finns särskilt i vävnader då det bland annat består av ett nätverk och proteinfiber.

Förklara cytoskelettet?

Cytoskelettet består av 3 stycken olika typer som alla byggs upp av olika proteiner.

1. Microtubuli

2. Actin filament

3. Intermediära filament

Dessa står för cellens form, förflyttning och trafik av vesiklar och organeller. De står även för

celldelningen.

Hur specialiseringar i cellens utbyggnad och funktion uttrycks?

Alla celler har samma grundläggande uppsättning av organeller. Specialisering innebär bla:

- Förändrad protein- och lipidsyntes.

- Morfologiska förändringar.

- Ändrat mängdförhållande mellan organeller.

Tex. neuron, fettcell eller ljusceller är specialanpassade för att kunna sin funktion.

Se exempel CASE 1!

Våglängd och ljusmikroskopi?

Mikroskop används för att visualisera små strukturer. Ju kortare våglängd desto mindre strukturer ser man. Ögat kan ta emot ljus som har våglängd 0,2mm och för att få så kort våglängds som möjligt krävs hög energi.

Vilka tre kvalitet bedöms mikroskopet av?

Skärpedjup, kontrast och upplösning.

Fördelar och nackdelar med Elektronmikroskopi?

Analyserar elektronernas fördelning. Svart/Vit bild. Ger en stor förstoring som kan ge många detaljer. Elektronmikroskopi visar membraner. Ju

elektrontätare desto mörkare blir bilden. Måste dock ha tillräckligt högt "skikt" för att kunna se inuti cellkärnan.

Fördelar och nackdelar med Ljusmikroskopi?

Lättillgänglig och man kan se vävnader, dock dålig upplösning om man vill se mindre detaljer och strukturer.

Fördelar och nackdelar med Fluorescensmikroskopi?

färgar in olika strukturer i cellen. Kan belysa organeller som man annars inte ser och ser hur den arbetar, tex transporten av proteiner. Kan belysa substanser

som förekommer i låg koncentration. Man får dock ingen helhetsbild och man missar hur de samverkar.

Vad är elektronnegativitet?

Elektronegativitet är ett mått på hur starkt de olika atomerna i en molekyl attraherar elektroner.

Vad innebär oktettreglen?

Oktettregeln säger att en atom "strävar efter" att ha 8 valenselektroner. Detta kan ske genom hela elektronövergångar för att skapa joner, eller genom delning av elektroner via kovalenta bindningar.

Oktettreglen och kovalent bindning?

Liten/ ingen skillnad i elektronegativitet. Atomerna delar på elektronerna för att uppnå 8 valenselektroner och bilda en molekyl, ex vatten.

Oktettreglen och jonbinding?

Stor skillnad i elektronegativitet. En vill avge, en vill uppta elektroner för att få ett fullt elektronskal.

Tex. Na + Cl ® NaCl (Na avger e-, Cl tar upp e-) Dett sker genom en nuckleofil attack då en eller flera elektroner hoppar över.

Vilka två sätt kan oktettreglen uppstå?

Genom oxidationstal och gemensamma elektroner.

Vilka former kan man beskriva/rita en molekyl med?

Strukturformel, Molekylformen/summaformel och Sträckformel.

Kunna förklara hur starka syror protolyseras, ex HCL (saltsyra)?

Starka syror avger sina protoner fullständigt. Saltsyra släpper alltså alla sin protoner så produkterna blir vätejoner och kloridjoner.

Vilka undantag av oktettregeln finns det?

- Fria radikaler, oparade elektroner.

- Tyngre element som har fler än 4 stycken elektronpar.

- Bhor, har för få elektronpar, enbart tre par.

Vilka värden på oxidationstal utgår man ifrån?

Syre: -2

Väte: +1

Alkalimetaller: +1

Vart buffrar det bäst?

Vid pKA, där det finns lika mycket av syraformen och basformen.

Hur sker en substitutionsreaktion?

Med en nukleofilattack då en negativ grupp 1 attackerar en positivgrupp som redan binder till negativ grupp 2. När negativ grupp 1 så släpper negativ grupp 2 och på så sätt kan två grupper byta plats.

Vad sker vid en eliminationsreaktion?

En dubbelbindning uppstår.

Vad sker vid en additionsreaktion?

En dubbelbinding bryts för att kunna binda till något annat skit.

Klara undrar hur fan man kan se att något har oxiderats?

Ebba svara och fattar 0 men rätt svar är att det bildas mycket syre eller dubbelbindningar och det random ämne har höjt sitt oxidationstal.

Vad är Osmos?

Diffusion genom ett semipermeabelt membran som utjämnar koncentrationsgradienter. Det har en kolligativ egenskap, beroende av antal och inte sorten.

Vad innebär det att en molekyl är av optisk isomer?

Molekyler som är spegelbilder till varandra bryter polariserat ljus olika.

Hur namnges karboxylsyror?

Alkennamn + syra. Många har även trivialnamn. Anjonformen av en karboxylsyra namnges med suffixet -oat (eller -at).

Hur namnges estrar?

1. kedjan som binder till syran (ofta en alkohol) 2. Karboxylsyran (anjonformen) -oat.

2 typer av sockerarter?

aldoser och ketoser

Vilka 3 typer av isomerer finns det?

Konstitutionella: olika plats på grupper.

Stereoisomerer: samma plats men olika riktning.

Konformerer: samma molekyl som kan växla mellan olika former.