Geenitekniikka

Geenitekniikka

Perintöaineksen eristämistä, analysointia, muokkaamista ja siirtämistä muihin eliöihin tai soluihin.

Sokeri, vetysidos, fosfaatti, emäs

Koodaava alue

Osa geeniä joka luetaan esiaste-RNA:ksi

Säätelyalue

(Regulatory segment); Geenin luennan aloittamisen ja luennan säätelyyn osallistuva alue, joka sijaitsee ennen geenin koodaavaa aluetta. Sisältää tehostajajaksoja ja promoottorin.

Eksoni

Geenin koodaavan alueen jakso, jonka informaatio siirtyy lähetti-RNA:han ja sitä kautta proteiinisynteesissä syntyvään aminohappoketjuun.

Introni

Tumallisilla eliöillä geenin proteiinia koodavan alueen jakso, joka ei sisällä proteiinin rakentamisessa tarvittavaa informaatiota. Intronit silmukoidaan pois esiaste-RNA:sta.

Säätelyalue sisältää

Tehostajajaksot, promoottorin

Geenin koodaava alue sisältää

Intronit, eksonit

DNA-polymeraasi

DNA-kaksoisjuostetta syntesisoiva eli rakentava entsyymi. DNA polymeraasi käyttää mallina vastakkaissuuntaista juostetta, ja se kykenee rakentamaan uutta juostetta vain yhteen suuntaan (3´ -> 5´). DNA polymeraaseja on useita ja niitä tarvitaan solunjakautumisessa ja vaurioituneen DNA:n korjauksessa.

kromosomi, kromatiini, histoniproteiineja

Katkaisu katkaisuentsyymillä, yksijuosteisten päiden pariutuminen, sokeri-ja fosfaattiosan yhteenliittäminen liittäjäentsyymillä

Katkaisuentsyymi, restriktioentsyymi

Entsyymejä, jotka katkaisevat DNA:n kaksoisjuosteen. Geenitekniikassa käytettävät entsyymit katkaisevat sen aina tietyn emäsjärjestyksen kohdalta

Liittäjäentsyymi, ligaasi

Entsyymi, joka katalysoi kahden molekyylin liittämistä toisiinsa. Ligaaseja ovat mm. DNA:n paloja yhteen liittävät entsyymit. Käytetään geenitekniikan työkaluina.

Crispr-tekniikka

Geenimuokkaustekniikka, jossa Cas-entsyymin avulla leikataan DNA kaksoijuoste tarkasti juuri tietyn emäsjärjestyksen kohdalta. Cas entsyymi ohjataan haluttuun kohtaan opas-RNA:n avulla. Opas-RNA voidaan tehdä laboratoriossa juuri halutunlaiseksi. Tekniikkaa käytetään poisto- ja siirtogeenisten eliöiden tuottamiseen.

Cas-entsyymi

Bakteerien entsyymi, joka vastaa bakteerien immunologisesta muistista bakteriofageja vastaan. Tunnistaa virus- DNA:n ja pilkkoo sen palasiksi, mikä seurauksena viruksen lisääntyminen estyy. Käytetään crispr-tekniikassa, kun halutaan esim. muokata geenejä tai tehdä niitä toimintakyvyttömiksi.

Käänteiskopioijaentsyymi

(Reverse transcriptase); Entsyymi, jonka avulla yksijuonteinen lähetti-RNA saadaan käännettyä vastin-DNA:ksi (komplementaariseksi). Käytetään bioteknologiassa esim silloin, kun halutaan siirtä tumallisen eliön geeni bakteeriin.

Vastin-DNA, cDNA

Lähetti-RNA:n emäsjärjestyksen perusteella kopioitu DNA, joka sisältää vain geenien eksonit.

Yhdistelmä-DNA-tekniikka

(Recombinant DNA technique); Geenitekniikan menetelmä, joissa kaksi DNA-juostetta liitetään yhteen, jolloin syntyy uudenlaisia yhdistelmä-DNA molekyylejä. Yleisimmin yhdistelmä-DNA tekniikassa käytetään bakteerien plasmideja, joiden avulla vierasta DNA:ta siirretään bakteereihin tai muihin eliöihin.

Antibioottivalinta

Menetelmä, jonka avulla etsitään tietylle antibiootille vastustuskykyisiä bakteereita. Geenisiirrossa voidaan käyttää apugeeninä antibioottiresistenssin geeniä. Sen perusteella tehtävän antiobioottivalinnan avulla löydetään bakteerit, joissa siirtogeeni on.

Polymeraasiketjureaktio, PCR

Menetelmä, jonka avulla DNA-molekyyliä voidaan monistaa nopeasti koeputkessa.

Aluke

(Primer); Lyhyt yksijuosteinen DNA-jakso, joka tarvitaan aloittamaan koeputkessa DNA-polymeraasin toiminta ja DNA:n kahdentaminen

Elektroforeesi

Laboratoriomenetelmä, jossa erotellaan erikokoisia molekyylejä sähkövirran avulla. DNA ja RNA molekyylien erottely perustuu erikokoisten palasten liikkumisnopeuteen agaroosigeelissä.

Alleeli

Mutaation tuloksena syntynyt geenin vaihtoehtoinen muoto. Vastinkromosomien saman lokuksen alleelit voivat olla erilaiset tai samanlaiset.

Koetin

Lyhyehkö merkkiaineella varustettu DNA tai RNA jakso, jonka avulla voidaan löytää tietty emäsjärjestys perimästä. Koetin tarttuu emäspariperiaatteen mukaan kohtiin, joissa on vastaava emäsjärjestys

Hybridisaatio

DNA- tai RNA- juosteiden taipumus muodostaa emästen välisiä sidoksia ja liittyä niiden avulla toisiinsa.

DNA-siru, mikrosiru

Lasinen tai muovinen pieni levy, johon sijoitetaan tutkittavaksi ja tunnistettavaksi jopa kymmeniä geenejä.

Sekvensointi

Nukleiinihappojen emäsjärjestyksen tai proteiinien aminahappojärjestyksen selvittäminen

Rinnakkaissekvensointi

Erittäin nopea sekvensointi jonka avulla saadaan hyvin nopeasti kartoitettua kokonaisen genomin emäsjärjestys.