DNA replikation

vilka är byggstenarna i DNA och RNA

• kvävebas: A, T/U, C, G

• nukleotid: pentose

• phosphate

vilka kvävebaser är purines

adenine och guanine

vilka kvävebaser är pyrimidines

cytosine, thymine, uracil

vad är skillnaden mellan deoxyribonucleotider och ribonucleotider

• ribonukleotider innehåller ribos med en OH på 2’-kolet

• deoxyribonukleotider innehåller deoxiribos med ett H PÅ 2’-kolet

• RNA innehåller uracil medan DNA innehåller Tymin

• RNA är mindre stabilt eftersom OH gruppen kan delta i hydrolysreaktioner medan DNA är mer stabilt och därav mer lämpligt för långsiktig lagring av genetisk information

• RNA är enkelsträngat medan DNA är dubbelsträngat

vad är 5’ och 3’ ände

• 5’ änden är där fosfatgruppen sitter på kol 5’

• 3’ änden är där hydroxylgruppen (OH)sitter på kol 3’

varför är 5’ och 3’ viktig

• DNA skrivs från 5’ → 3’

• DNA-polymeras kan bara lägga till nya nukleotider på den fria 3’-OH gruppej

vilka basparar med varandra och vilken basparning är starkast?

• Adenin para med Tymin/uracil

• guanin parar med cytosin

• G-C är starkast eftersom de har tre vätebindningar medan A-T bara bildar 2 vätebindningar

Vilka tre faser finns i DNA replikation?

• initiering

• elongering

• terminering

initiering

• replikationen börar vid en origin of replication

• Helikas öppnar upp DNA-helixen genom att bryta vätebindningarna mellan basparen

• SS-bindande protein (singl-strand binding proteins) binder till enkelsträngarna och hindrar de från att para ihop sig igen

• topoisomeras “avlastar” DNAt genom att tillfällit klippa DNat för att släppa på spänningen

• ett open complex bildas eller sk replikationsbubbla och replikationsgaffeln kan skapas

• RNA-primer bygger startpunkten för DNA-polymeraset

elongering

• DNA-polymeras III bygger på med kvävebaser

• riktningen 5’ → 3’

• på leading strand så passar detta perfekt och den kan syntetisera kontinuerligt

• men på lagging strand så måste den jobba i sk okazakifragment

• DNA polymeras I tar bort RNA och sätter dit DNA

• DNA ligas klistrar ihop fragmenten

• båda replikeras skenbart åt samma håll pga av att en ögla gör att lagging strand hamnar åt samma håll

förklara introner och exoner

• introner är icke kodande DNA som processas bort vid vidare kodning

• exoner är kodande DNA som splicas ihop efter det att introner klyvs bort

• de finns för att samma gen ska kunna ge upphov till flera olika proteiner via alternativ slicing