Tema 3: Introducción a las proteínas

¿Por qué son las proteínas tan importantes?

Porque son las moléculas más importantes de los seres vivos y desempeñan funciones cruciales en todos los procesos biológicos

¿Qué son las proteínas?

Las proteínas son polímeros linasles construidos a partir de monómeros llamados aminoácidos unidos entre sí.

¿Cuál es la estructura primaria de las proteínas? Explíca las partes de esta estructura

Son los aminoácidos. Estos estan compuestos por un grupo amino, carboxilo, un hidrógeno y un radical específico de cada aminoácido.

¿Cómo se unen unos aminoácidos con otros? ¿Por qué son tan importantes comparado con el resto de estructuras de las proteínas?

Los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces peptídicos.

Son tan importantes porque de esta estructura dependen el resto de estructuras

Explica la estructura secundaria

La cadena se dispone de forma tridimensional

Explica la estructura terciaria

Es el plegamiento de la estructura secundaria

Explica la estructura cuaternaria

Es la agrupación de estructuras terciarias y no es obligatoria

¿Qué es la quiralidad?

La quiralidad solo ocurre con carbonos asimétricos y es una propiedad de un objeto de desviar la luz a la izquierda (levógiro) o a la derecha (dextrógiro)

¿Son todos los carbonos centrales de los aminoácidos asimétricos?

¿Predomina el isómero D- o el L-?

No, ya que la glicina no tiene un carbono asimétrico, por lo que no es un aminoácido quiral.

Predomina el isómero L-

¿Qué tienen de especial los aminoácidos aromáticos?

Que son apolares por el anillo aromático, por lo que pueden participar en interacciones hidrofóbicas especialmente fuertes. Su grupo -OH puede formar puentes de hidrógeno

¿Que tienen de especial los aminoácidos ácidos y básicos?

Pues que están ionizados a su pH fisiológico, pero sus cadenas laterales determinan la carga del pH

¿Qué son los aminoácidos esenciales?

Son aminoácidos que no son sintetizados por el organismo pero son necesarios consumirlos en la dieta

¿Qué son los aminoácidos standards?

Son aminoácidos que derivan de otros. Cumplen funciones más específicas.

¿Qué son los aminoácidos no proteicos?

Son biologicamente importantes pero no se encuentran en las proteínas.

¿Qué es la propiedad espectroscópicas? Da un ejemplo

Es una propiedad que permite a los aminoácidos absorber la region infra-roja (luz ultravioleta)

Esto puede usarse para medir la cantidad de proteínas de una sustancia

Explica las propiedades ácido-base de los aminoácidos

Los aminoácidos tienen dos grupos ionizables, el carboxilo yel amino. El carboxilo se desprotona primero (pk1), después se desprotona el radical (pkr) si es que es ionizable y por último el amino (pk2) debido a sus valores de pK.

El aminoácido por tanto puede aparecer en forma catiónica (carga positiva), neutra o aniónica (carga negativa), dependiendo del pH del medio.

¿Que es un equivalente?

Un equivalente en un aminácido ácido es la cantidad de base que hay que añadir para que todas las moléculas tengan su primer grupo desprotonable (el carboxilo) desprotonado.

Si se sigue añadiendo base se desprotonará el grupo amino o el radical si es posible.

¿Cómo se forma un enlace peptídico?

Se forma cuando dos aminácidos se unen mediante una reacción de condensación entre el grupo carboxilo de uno y el amino del otro. Este enlace es tipo amida

Dime las características del enlace peptídico

Al tener un carácter parcial de doble enlace no permite rotación entre la unión del carboxilo y el amino. Esto provoca que haya dos tipos de aminoácidos: cis y trans, siendo este último el más común porque ocupa menos.

Tiene una estructura polar y es plano, es decir, todos sus elementos se encontrarán en el mismo plano

¿De qué dependerá la conformación del polipéptido?

Esta dependerá de los ángulos de torsión alrededor del punto de giro. Debido al espacio no todas las posiciones serán posibles.

Dime que componentes de una cadena de aminoácidos son ionizables

Solo son ionizables el primer grupo amino (amino terminal), el último grupo carboxilo (carboxilo terminal) y los radicales capaces de ionizarse de algunos aminoácidos

¿Qué significa que un polipéptido sea polianfolito?

Significa que se pueden ionizar varios grupos funcionales de ese polipéptido, por lo que tendrá varias curvas de ionización

Dime dos maneras de romper el enlace peptídico

Puede darse mediante una ruptura química, como el bromuro de cianógeno, la hidroxilamina, etc

O mediante una ruptura enzimática, como la tripsina, la clostripaína o la trombina