I Batteriofagi e i loro Cicli Vitali

Flashcard vocabolario basate sulla lezione sui batteriofagi, coprendo strutture capsidiche, genomi specifici e cicli replicativi.

Batteriofagi (o fagi)

Agenti infettivi di piccole dimensioni ($10 - 300\,nm$) che infettano cellule procariotiche e sono incapaci di vita autonoma.

Capside

Involucro proteico che riveste il genoma virale, formato dalla ripetizione di una o poche specie diverse di proteine.

Capsomeri

Subunità proteiche che si uniscono in gruppi di $5/6$ unità per formare la struttura del capside.

Capside Icosaedrico

Struttura a forma di icosaedro regolare con $20$ facce a triangolo equilatero, dove ogni faccia è costituita da capsomeri sferici.

Struttura Testa-e-coda

Morfologia specifica dei batteriofagi composta da una testa contenente l'acido nucleico e una coda filamentosa con strutture addizionali per l'ingresso nella cellula.

Fagi T-pari

Gruppo di virus (T2, T4, T6) che infettano E. coli, dotati di un genoma a DNA lineare a doppio filamento di $168\,kb$ che codifica per circa $300$ geni.

Piastra basale

Componente terminale della coda dei fagi T-pari provvista di fibre che servono a localizzare i recettori sulla cellula batterica.

Fago $fX174$

Batteriofago con capside icosaedrico e genoma a DNA circolare a singolo filamento di circa $5.4\,kb$ che codifica per $11$ geni.

Geni sovrapposti

Geni in cui proteine diverse sono sintetizzate dalla stessa sequenza di DNA partendo da diverse cornici di lettura (mRNA tradotto da diversi codoni AUG).

Replicazione a cerchio rotante

Meccanismo di replicazione di $fX174$ e $\lambda$ dove la sintesi su uno stampo circolare genera una coda a singolo filamento con più copie del genoma.

Fago $\lambda$

Batteriofago che infetta E. coli con un genoma a DNA a doppio filamento di $50\,kb$ che codifica per circa $50$ geni.

Sequenze cos

Estremità coesive di $12$ nucleotidi a singolo filamento complementari tra loro, situate alle estremità del genoma lineare del fago $\lambda$.

Concatamero

Molecola risultante dalla replicazione a cerchio rotante del fago $\lambda$, composta da copie multiple del genoma ripetute in tandem.

Enzima Ter

Enzima che effettua un taglio sfalsato nelle sequenze cos del concatamero per separare i singoli genomi di $\lambda$.

Fago virulento

Batteriofago che segue esclusivamente il ciclo litico, portando alla lisi e alla morte della cellula batterica ospite.

Fago temperato

Batteriofago che può seguire il ciclo lisogeno, integrandoli nel cromosoma batterico senza replicarsi immediatamente.

Profago

Stato del genoma fagico quando rimane quiescente e integrato all'interno del cromosoma del batterio ospite.

Induzione

Processo mediante il quale il genoma del fago si escinde dal cromosoma batterico, passando dal ciclo lisogeno alla fase litica.

Sito att

Sequenza di $15\,bp$ condivisa dai genomi di $\lambda$ e E. coli dove avviene l'integrazione sito-specifica.

Integrasi (Int)

Proteina fagica che catalizza la ricombinazione necessaria per l'integrazione del DNA di $\lambda$ nel genoma di E. coli.