Opšta Biohemija - Replikacija, Transkripcija i Translacija

Flashkartice sa ključnim pojmovima i definicijama iz molekularne biologije i biohemije, zasnovane na ispitnim pitanjima o replikaciji, transkripciji i translaciji.

Topoizomeraza I

Enzim koji tokom replikacije seče jedan lanac DNK i ne troši energiju u vidu ATP-a.

Topoizomeraza II

Enzim koji seče oba lanca DNK, troši ATP i uvodi negativne supernavoje.

Prokariotska iRNK

Policistronski molekul koji ne podleže isecanju introna i može odmah, bez modifikacija, ići u proces translacije.

Eukariotska iRNK

Monocistronski primarni transkript koji sadrži introne i zahteva post-transkripcionu obradu (5'-kapa, poli-A rep i isecanje introna).

DNK polimeraza I

Enzim koji poseduje 3’-5’ egzonukleaznu aktivnost i služi za uklanjanje RNK prajmera i popunjavanje praznina DNK segmentima.

DNK polimeraza III

Glavni enzim replikacije koji ne može samostalno da započne sintezu bez RNK prajmera.

RNK polimeraza

Enzim koji započinje proces transkripcije bez potrebe za prajmerom, sporiji je od DNK polimeraze i nema egzonukleaznu aktivnost.

Aminoacil-t-RNK-sintetaza

Enzim koji katalizuje specifično vezivanje aminokiseline za 3’ (CCA) kraj tRNK, pri čemu se troši energija ekvivalentna 2 molekula ATP-a.

Šajn-Dalgarnov niz

Specifična sekvenca u prokariotskoj iRNK koja omogućava njeno pravilno pozicioniranje na maloj subjedinici ribozoma.

Helikaza

Enzim koji raskida vodonične veze između baza u dvolančanom molekulu DNK, razdvajajući roditeljske lance.

SSB proteini

Proteini koji stabilizuju replikacionu viljušku i sprečavaju ponovno spajanje (renaturaciju) razdvojenih roditeljskih lanaca.

Pribnovljev blok (TATAAT)

Deo promotorskog regiona na poziciji $-10$ nukleotida uzvodno od mesta početka transkripcije kod prokariota.

Histoni

Bazni proteini bogati ostacima lizina i arginina koji nose pozitivno naelektrisanje i interaguju sa negativno naelektrisanom DNK formirajući nukleozome.

Okazakijevi fragmenti

Kratki segmenti DNK koji se inkorporiraju tokom replikacije zaostajućeg lanca (lagging strand).

dnaA protein

Protein čije je delovanje neophodno za početak procesa replikacije kod prokariota.

Start kodon

Triplet nukleotida AUG koji služi kao signal za početak translacije.

Stop kodoni

Tripleti nukleotida UAA, UAG i UGA koji signalizuju terminaciju procesa translacije.

DNK žiraza

Specifična topoizomeraza II kod $E. coli$ koja stvara negativne supernavoje u cirkularnoj DNK.

Prajmer

Kratak molekul RNK koji sintetiše enzim DNK primaza, neophodan za otpočinjanje aktivnosti DNK polimeraze III.

Gvanilil-transferaza

Enzim koji katalizuje vezivanje 5'-kape na eukariotske RNK molekule.

RNK polimeraza I

Eukariotska polimeraza zadužena za sintezu rRNK ($28s$, $18s$, $5,8s$).

RNK polimeraza II

Eukariotska polimeraza zadužena za sintezu iRNK i snRNK.

RNK polimeraza III

Eukariotska polimeraza zadužena za sintezu tRNK, $5s$ rRNK i snRNK.