R commands

ctrl+r v editoru

spouští code v console okně

• ?text

• ??text

• ukaze fci textu (např. příkazu)

• zkusit když nefunguje to první - prohleda vnitrni napovedu

(tyhle možnosti jde taky naklikat pod tlačítkem help)

example (lm)

ukaze nejaky prikad zadane funkce

"text text"

je potreba napsat kdyz ma zadávaný text víc slov

log(cislo, zaklad)

log10(cislo, zaklad)

command pro vypočítání logaritmu

dekadický logaritmus

fligner test

mediální test, shoda (homogenita) rozptylů mezi skupinami dat (jak se liší variabilita těchto skupin) - homoskedasticita

det

calculates determinant (číslo přiřazené matici |A|) ,

lze zadat matici

: r functions (text) ;

help()

getting help na webovy strance R

• vignette()

• demo()

nejaky informace o package idk

rseek

databáze na hledání pro komunitu R

CRAN task views

obsahuje vybrane balicky a jejich zakladni fce

stack overflow

stránka s faq, lze se tam ptát i odpovídat

1. install.packages("balicek")

2. loading: library(balicek)

3. library help(="balicek")

1. instaluje konkretni balicek (package)

2. cely balicek pripojen do aktivni pameti Rka (takze po tomhle muze fungovat vyhledavani pomoci ?)

3. nejaky vysvetleni

1. citation()

2. sessionInfo()

1. citace R

2. o verzi, jak nastavena, co pripojeno, atd

q() nebo file>exit

zavírání session

esc

#esc

kdyz zaseknute/nefunguje - prerusi bezici vypocet

ulozit: workspace, script-ulozena jako plain text ithink, lze editovat v cemkoliv

select+ctrl+r = runs celou selected cast

^ sipka nahoru prochazi predchozi commands?

zoo: originalne napsanl ajay shah. , fce: financni data, precist data v textovem dokumentu - prochazeni v case

vysledek <- cislo ; pak vysledek+ctrl+r rekne to cislo

workspace save - .ulozene v RData (binary code - kdyz je nakopirovan do slozky; file>load worskpace>ta slozka>ten soubor - bude znat promenne z toho souboru (treba vysledek), Rhistory (zipped txt - jde pouzivat sipka nahoru pak)

file>change directory>desired slozka ; getwd() - zjistis kam kouka asi?-adresář ; setwd() - kam ma koukat

lomitka: dopredu / vs dozadu \ \

tab na doplneni

aov

Fit an analysis of variance model by a call to lm (for each stratum if an Error(.) is used).

setwd()

nastavit domovsky adresar

• krabice<-”neco”

• krabice<-”klobouk”

• ls()

• jina.krabice<-”klobouk”

  • cislo<-56

  • odpoved<-TRUE

• krabice_c.2

• setne co je odpoved na krabice

• co když tam strčím neco jineho - prepise to predchozi objekt

• zjistim co mam za objekty?

• ?

logicke hodnoty {TRUE/T, FALSE/F..) - capslockem, nepocita se jako text

povolené znaky v R

rm(“krabice”)

smazat odpoved/objekt/promennou (napr. krabice)

• class(krabice)

• class(cislo)

• class(odpoved)

• typeof(krabice)

• typeof(cislo)

• typeof(odpoved)

• mode(krabice)

• mode(cislo)

• mode(odpoved)

zjisteni typu dat (3 zakladni typy: character, numeric, logical)-typy nelze michat dohromady (double, integr?)

• ###VEKTOR

• c()

  • zver<-c(“danek”,”knour”,”tetrev”)

  • cisla<-(“2”,”3”)

  • zviratka<-(zver, zoo) - ukaze prvky vsech skupin co patri do teto skupiny

  • meowing<-c(zoo,cisla) ; typeof(meowing) - rekne to, ze je to ”character” (sloucene typy v jedne skupine-prevede to i cisla na character, jsou v uvozovkach)

• skupina hodnot, kazda pro nejaky typ dat (nekolikaprvkove vektory)

• head(zviratka) - ukaze prvnich 6 z vektoru

  • head(zviratka,2)

• tail(zviratka) - poslednich 6 z vektoru

  • tail(zviratka,2)

obecne pouzitelne:

• table(zviratka) - ukaze objekty a kolik jich tam je

• length(zviratka)

• str(zviratka) - struktura objektu

• rep(zver,2) - repetition+kolikrat

• rep(zver,each=2) - repetition, aby byly u sebe

• rep(zver,c(2,1)) - kolikrat chci opakovat kazdy z prvku ve vektoru

pouzitelne na cisla:

• summary(cisla)

• min(cisla)

• max(cisla)

• sort(cisla)

• rank(cisla)

• mean(cisla)

• median(cisla)

• rev(cisla) - reverse

• 2:9 - ukaze cisla od .. do ..

• seq(from=2,to=10,legth.out=15) ???

• seq(from=10,to=2,by=0.35)

• abc<-(rep(1:10,10:1)) vektor, kde se opakuji cisla od 1 do 10, kazde cislo od 1 10x po 10 1x

• sample(zviratka,2) - vybere random objekty z mnoziny

• sample(zver,10,replace=TRUE) - po kazdem vyberu je doplnen objekt

• sample(zver) - vybere a promicha objekty

• sample(zver,20,replace=TRUE,prob=c(1,1,1,5)) - urcuje, s jakou pravdepodobnosti se vytahnou dane prvky podle zadaneho pomeru

  • table(sample(zver,20,replace=TRUE,prob=c(1,1,1,5))) - idk ukaze ty pravdepodobnosti

hod minci:

• sample(c(“hlava“,”orel”),1)

• sample(c("hlava","orel"),10,replace=TRUE) - 10 hodu minci

• cisla.rnorm<-rnorm(10,mean=2,sd=3) ?

• hist(cisla.rnorm) -histogram

• distributions ?

• byrow ?

MATICE = stejne jako vektor, ale jine rozmery (zna kolik ma radku a sloupcu)

• lovu_lesu<-sample(zver,10,replace=TRUE)

• dim(lovu_lesu)<-c(5,2) - vytvori matici ithink - zadano kolik ma radku a sloupcu

• matrix(2:21,nrow=4,ncol=5)

error=nevi co chces

warning=muzu udelat, ale not sure co chces

• vyska<-c(7,14,67,89)

• vyska+2

• sum(vyska)

• prod(vyska)

pocetni operace s vektory

factorial(10)

• round(teplota,digits=2) ; digits=pocet desetinnych mist

• trunc()

• floor()

• zaokrouhleni

• zaokrouhleni smerem k 0

• zaokrouhleni na ???

mean(vektor/100)

prumer v m kdyz mam udaje `v cm

5>3

5>=3

5==3 (kdyz chci napsat rovna se, mely by byt 2 rovnitka)

odpovedi je TRUE/FALSE

sum(vyska>15)

kolik objektu z vektoru splnuje danou podminku

• dela sumu true a false, true=1, false=0

• napr. T,T,F,T = 3 (secte logicke hodnoty prevedene na cisla)

c(1,5,8,9)+c(2,3)

soucet vektoru = kdyz maji ruzny pocet cisel, ten kratsi se zacne recyklovat, dokud se neco nepricte ke vsem cislum toho delsiho

• mean(vyska_chyba,na.rm=T)

• is.na(vyska_chyba)

• sum(is.na(vyska_chyba))

chybna data

• vyska_chyba<-c(9,8,5,NA,1)

takto R vyignoruje to NA a udela prumer zbylych hodnot

• dim(vector)

• length(vector)

• str(vector)

• summary(vector)

• dimnames(vector)

  • rownames(vector)<-(“L1“,”L2”,”L3”)

  • colnames(vector)<-(“dub“,”buk”,”smrk”,”borovice”)

  • rowSums(vector)

  • colSums(vector)

  • rowMeans(vector)

  • colMeans(vector)

• vector2<-cbind(vector, javor=c(2,3,7))

• poctyL<-rbind(vector, L4=c(4,0,2,1))

• dimenzionalita matice

• length delka idk?

• dim nazvy radku a sloupcu

  • pojmenovavani

  • a tak o radcich a sloupcich

  • prumer radku a sloupcu

• pripojeni novy veci do existujici tabulky(matice?)

• pridani radku do vektoru

• rostliny<-data.frame(id=c(“R1“,”R2”,”R3”,”R4”) atd….)

  • class(rostliny)

  • class(rostliny$id)</p></li><li><p>class(rostliny$vyska)

  • str(rostliny)

data frame = tabulka dat, kazdy sloupecek muze byt jiny typ promenne

(napr. druh, vyska, hnojeni)

• vyzkum<-list(pocty,… blebleble)

• is.numeric(pocty) ; is.matrix(pocty) ; is.data.frame(rostliny) ; is.list(rostliny) ; ….

• unlist(vyzkum)

• as.vector ; as.matrix