دوسية كيمياء الحياة - أحياء توجيهي 2009

بطاقات استذكار للمفاهيم والمصطلحات الرئيسية في وحدة كيمياء الحياة لمادة الأحياء (توجيهي 2009).

المركبات العضوية الحيوية

مركبات كيميائية توجد في أجسام الكائنات الحية، ويدخل في تركيبها بصورة أساسية ذرات الكربون والهيدروجين، ويدخل في تركيب بعضها أيضا ذرات عناصر أخرى مثل النيتروجين والأكسجين.

السكريات الأحادية

أبسط أنواع الكربوهيدرات، تذوب في الماء بسهولة (لأنها من المواد المحبة للماء) وصيغتها العامة هي $(CH_2O)_n$ حيث $n$ عدد ذرات الكربون.

السكريات الثنائية

سكريات يتكون كل منها من وحدتين من السكريات الأحادية، ترتبطان معا برابطة تساهمية غاليكوسيدية.

السكريات المتعددة

مبلمرات تتكون من سكريات أحادية (أو مشتقاتها) ترتبط فيما بينها بروابط تساهمية غاليكوسيدية.

الدهون الثلاثية

أحد أنواع الليبيدات، وتتكون من اتحاد جزيء واحد من الغليسرول مع ثلاثة جزيئات من الحموض الدهنية بروابط تساهمية إسترية.

الستيرويدات

أحد أنواع الليبيدات، وتتكون من أربع حلقات كربونية ملتحمة، ثلاث منها سداسية وواحدة خماسية، إضافة إلى مجموعة كيميائية ترتبط بالحلقة الرابعة.

الليبيدات المفسفرة

أحد أنواع الليبيدات، وتتكون من جزيء غليسرول يرتبط بمجموعة فوسفات وبجزيئين من الحموض الدهنية.

الصيغة البنائية العامة للحموض الأمينية

تتكون من ذرة كربون مركزية مرتبطة بمجموعة كربوكسيل ($COOH$)، ومجموعة أمين ($NH_2$)، وذرة هيدروجين ($H$)، وسلسلة جانبية ($R$).

التركيب الأولي للبروتين

التسلسل الخطي للحموض الأمينية في سلسلة عديد الببتيد المرتبطة بروابط تساهمية ببتيدية، وله طرفان: الطرف N (مجموعة الأمين) والطرف C (مجموعة الكربوكسيل)، ولا يؤدي أي وظيفة في صورته الأولية.

حلزون ألفا

تركيب ثانوي ينتج عند التفاف سلسلة عديد الببتيد وتكون روابط هيدروجينية بين ذرة الأكسجين في مجموعة الكربوكسيل في حمض أميني وذرة الهيدروجين في مجموعة الأمين في حمض أميني آخر يبعد عنه أربعة حموض أمينية.

الصفيحة المطوية بيتا

تركيب ثانوي ينتج عند ارتباط جزأين أو أكثر من سلسلة عديد الببتيد نفسها بروابط هيدروجينية، حيث تكون هذه الأجزاء المكونة لسلسلة عديد الببتيد بجانب بعضها في شكل متعرج.

التركيب الثالثي للبروتين

تركيب ينتج من طي التراكيب الثانوية في سلسلة عديد الببتيد، وتعمل أنواع مختلفة من الروابط بين ذرات السلاسل الجانبية $R$ على تثبيت شكله.

التركيب الرباعي للبروتين

تركيب بروتيني يتكون من سلسلتين أو أكثر من عديد الببتيد، ويثبت عن طريق روابط مختلفة شأنه شأن التركيب الثالثي.

البروتينات الكروية

بروتينات ذات تركيب ثالثي أو رباعي ذائبة في الماء لأن سلاسلها الجانبية $R$ القطبية تتجه نحو الخارج مواجهة للمحاليل المائية.

البروتينات الليفية

بروتينات ذات تركيب ثانوي أو ثالثي أو رباعي غير ذائبة في الماء لأن سلاسلها الجانبية $R$ غير القطبية غالباً تتجه نحو الخارج بمواجهة المحاليل المائية.

مولدات الضد

بروتينات ترتبط بالسكريات توجد على سطوح خلايا الجسم بشكل طبيعي.

النيوكليوتيد

الوحدة البنائية للحموض النووية، ويتكون من سكر خماسي ومجموعة فوسفات وقاعدة نيتروجينية.

البيورينات

قواعد نيتروجينية تتكون من حلقتين، وتضم الغوانين ($G$) والأدينين ($A$).

البيريميدينات

قواعد نيتروجينية تتكون من حلقة واحدة، وتضم اليوراسيل ($U$) والثايمين ($T$) والسايتوسين ($C$).

الجين

وحدة المعلومات الوراثية، وهو جزء من $DNA$ يحتوي على تسلسل محدد من النيوكليوتيدات.

طاقة التنشيط

الطاقة اللازمة لبدء التفاعل الكيميائي.

الموقع النشط

تجويف يتكون من حموض أمينية معينة، ويمثل مكان حدوث التفاعل، ويعمل قالبا ترتبط به المادة التي يؤثر فيها الإنزيم.

فرضية القفل والمفتاح

فرضية تقوم على أن شكل المادة المتفاعلة يتوافق تماماً مع شكل الموقع النشط للإنزيم.

فرضية التلاؤم المستحث

فرضية تقوم على أن شكل الموقع النشط للإنزيم يتغير تغيرا بسيطا ومؤقتا عند ارتباط المادة المتفاعلة به، لكي يصبح ملائما لشكلها.

مرافق الإنزيم

عوامل عضوية مساعدة للإينزيمات، بعضها تؤدي دورا في تفاعلات الأكسدة والاختزال التي تحدث في الخلية.

أدينوسين ثالثي الفوسفات (ATP)

جزيء عضوي يخزن الطاقة اللازمة لمعظم العمليات التي تحدث داخل خلايا الكائنات الحية، ويتكون من القاعدة النيتروجينية أدينين وسكر الرايبوز وثلاث مجموعات فوسفات.

عمليات البناء

مجموعة من التفاعلات الكيميائية التي يتم فيها بناء جزيئات كبيرة ومعقدة من جزيئات بسيطة وتنتج طاقة يتم تخزينها في الروابط الكيميائية للجزيئات الكبيرة.

عمليات الهدم

مجموعة من التفاعلات التي تحطم فيها بعض الجزيئات الكبيرة إلى جزيئات أبسط لإطلاق الطاقة الكيميائية المخزنة في الروابط الكيميائية للجزيئات الكبيرة.

التحلل الغلايكولي

المرحلة الأولى من التنفس الخلوي، وهو سلسلة من التفاعلات الكيميائية التي تحدث في السيتوسول، ولا تحتاج إلى أكسجين، ويتحطم فيها جزيء غلوكوز إلى جزيئين من البيروفيت.

الفسفرة التأكسدية

عملية إنتاج $ATP$ عن طريق سلسلة نقل الإلكترون والأسموزية الكيميائية، وتتضمن تفاعلات أكسدة واختزال.

الأسموزية الكيميائية

عودة البروتونات ($H^+$) نتيجة لفرق التركيز على جانبي غشاء الميتوكندريا الداخلي إلى داخل الحشوة عن طريق إنزيم إنتاج $ATP$.

التخمر

عملية تحدث في السيتوسول عند عدم توافر كميات كافية من الأكسجين، وتبدأ بالتحلل الغلايكولي ثم تنتقل الإلكترونات من $NADH$ إلى البيروفيت أو أحد مشتقاته.