Biochimie - Acides Aminés et Peptides

Flashcards de vocabulaire sur le cours des Acides Aminés et Peptides en Biochimie (UE2).

Masse moléculaire moyenne d'un résidu d'acide aminé

Masse d'environ $110\text{ Da}$, permettant d'estimer la masse moléculaire d'une protéine à 10\text{ %} près.

Glycine (Gly / G)

Acide aminé apolaire aliphatique le plus léger ($57\text{ Da}$) et le plus petit, dont le radical $R$ est un atome d'hydrogène ($H$), ne possédant pas de carbone $\text{C}_\text{α}$ asymétrique.

Tryptophane (Trp / W)

Acide aminé apolaire aromatique le plus lourd ($186\text{ Da}$), possédant un noyau indol volumineux et présentant l'absorbance la plus élevée dans l'ultraviolet à $280\text{ nm}$.

Proline (Pro / P)

Acide aminé apolaire dont le radical $R$ forme un cycle imino-acide lié à la fois au $\text{C}_\text{α}$ et à l'azote, conférant de la rigidité à la structure protéique.

Méthionine (Met / M)

Acide aminé apolaire aliphatique contenant un atome de soufre substitué par un groupement méthyle, jouant un rôle de donneur de groupement méthyle.

Cystéine (Cys / C)

Acide aminé polaire neutre à fonction thiol ($-\text{SH}$) réactionnelle, capable de former de manière réversible des ponts disulfures (cystine) par oxydation.

Asparagine (Asn / N)

Acide aminé polaire neutre à fonction amide dérivé de l'acide aspartique, intervenant dans la $\text{N}$-glycosylation des glycoprotéines.

Acide aspartique (Asp / D)

Acide aminé polaire ionisable dicarboxylique portant une seconde fonction acide carboxylique sur sa chaîne latérale, caractérisé par un $\text{pK}_\text{R} = 3{,}9$.

Acide glutamique (Glu / E)

Acide aminé polaire ionisable dicarboxylique portant une seconde fonction acide carboxylique sur sa chaîne latérale, caractérisé par un $\text{pK}_\text{R} = 4{,}1$.

Histidine (His / H)

Acide aminé polaire ionisable à noyau imidazole, caractérisé par un $\text{pK}_\text{R} = 6{,}0$, possédant un pouvoir tampon au pH physiologique et très fréquent dans les sites actifs d'enzymes.

Lysine (Lys / K)

Acide aminé polaire ionisable basique portant une fonction amine primaire sur son carbone $\text{C}_\text{ε}$, caractérisé par un $\text{pK}_\text{R} = 10{,}5$.

Arginine (Arg / R)

Acide aminé polaire ionisable basique avec une chaîne latérale portant un groupement guanidinium, caractérisé par un $\text{pK}_\text{R} = 12{,}5$.

Sélénocystéine (Sec / U)

Le $21^\text{ème}$ acide aminé naturel contenant un atome de sélénium, codé par le codon stop UGA combiné à une structure secondaire d'ARNm, formé à partir de la sérine.

Acides aminés essentiels

Acides aminés qui ne peuvent pas être synthétisés de novo par l'organisme (ou en quantité suffisante) et doivent être apportés par l'alimentation : leucine, lysine, méthionine, phénylalanine, thréonine, tryptophane, isoleucine, valine.

Zwitterion

Composé diplolaire possédant une charge positive sur un atome et une charge négative sur un autre atome, de charge globale neutre au pH physiologique.

Point isoélectrique (pI ou pHi)

Valeur de pH pour laquelle un acide aminé ou une protéine possède une charge électrique nette neutre (forme zwitterionique).

Liaison peptidique

Liaison amide covalente plane, rigide et polaire formée par condensation du groupe $\text{α}$-carboxyle d'un acide aminé avec le groupe $\text{α}$-aminé d'un autre acide aminé, avec élimination d'eau.

Absorbance dans l'UV des acides aminés aromatiques

Propriété liée aux électrons $\text{π}$ délocalisés du cycle aromatique provoquant un pic d'absorption à $270\text{ - }280\text{ nm}$, selon l'ordre : $\text{Trp} > \text{Tyr} \text{ >> } \text{Phe}$.

Réaction du Biuret

Réaction spécifique des liaisons peptidiques utilisant du $\text{CuSO}_4$ en milieu alcalin pour former un complexe violet absorbant à $535\text{ nm}$, utilisée pour le dosage des protéines.

Glutathion

Tripeptide ($\text{γ-glutamyl-cystéinyl-glycocolle}$) jouant un rôle crucial dans le maintien du potentiel réducteur du cytosol et la protection contre le stress oxydatif.

Vasopressine

Hormone neuropeptidique antidiurétique favorisant l'absorption de l'eau au niveau du rein et l'augmentation de la pression artérielle.

Ocytocine

Hormone neuropeptidique favorisant les contractions musculaires de l'utérus lors de l'accouchement, différant de la vasopressine par seulement 2 acides aminés.

Peptide C

Fragment peptidique libéré lors de la protéolyse limitée de la proinsuline en insuline active, servant d'indicateur indirect de la production d'insuline.