Oksidoreduktazės

Pagrindinės sąvokos ir apibrėžimai apie oksidoreduktazes.

Oksidoreduktazės

Fermentų klasė, katalizuojanti redokso reakcijas (elektronų pernašą).

Redukcija

Procesas, kurio metu elektronų akceptorius (oksidatorius) prisijungia elektroną (-us).

Oksidacija

Procesas, kurio metu elektronų donoras (reduktorius) atiduoda elektroną (-us).

Dehidrogenazės

Oksidoreduktazių grupė, katalizuojanti substrato oksidaciją/redukciją, naudojant NAD(P)+/NAD(P)H, flavininius kofermentus, citochromus, chinonus kaip elektronų akceptorius/donorus (išskyrus deguonį ir jo formas).

Hidrogenazės

Nuo metalų priklausomi fermentai, aptinkami įvairiuose mikroorganizmuose, tiriami dėl panaudojimo vandenilio biokuro celių kūrime.

Nitrogenazės

Fermentai, katalizuojantys azoto redukciją iki amoniako, pagrindiniai fermentai, atsakingi už azoto fiksaciją.

Dejodinazės

Fermentai, dalyvaujantys jodo apykaitoje, palaikantys balansą tarp laisvo jodo ir įkorporuoto į skydliaukės hormonus.

Oksigenazės

Oksidoreduktazės, oksiduojančios substratą deguonimi, įterpdamos deguonies atomą (-us) į jį.

Monooksigenazės

Oksidoreduktazės, naudojančios deguonį kaip galutinį elektronų akceptorių ir įterpiančios vieną deguonies atomą į substratą, o kitą redukuodamos iki vandens.

Dioksigenazės

Oksidoreduktazės, naudojančios deguonį kaip galutinį elektronų akceptorių ir dažniausiai įterpiančios abu deguonies atomus į substratą.

Oksidazės

Oksidoreduktazės, naudojančios deguonį kaip galutinį elektronų akceptorių, kuris redukuojamas iki vandens arba peroksido (deguonies atomai nėra įterpiami į substratą).

Peroksidazės

Oksidoreduktazės, naudojančios peroksidus kaip galutinį elektronų akceptorių, kuris redukuojamas iki vandens (ir/arba deguonies).

Peroksigenazės

Oksidoreduktazės, naudojančios peroksidus kaip elektronų akceptorių ir įterpiančios deguonies atomą į substratą.

sMMO

Tirpi metano monooksigenazė, vienas labiausiai biotechnologus intriguojančių oksidoreduktazių klasės fermentų

P450

Nuo hemo priklausomos monoksigenazės, dalyvaujančios ksenobiotikų skaidyme.

Flavino mononukleotidas (FMN)

Vienas iš flavininių kofermentų, dalyvaujančių oksidoreduktazių reakcijose.

Flavino adenino dinukleotidas (FAD)

Vienas iš flavininių kofermentų, dalyvaujančių oksidoreduktazių reakcijose.

Elektrofilinė ataka

Reakcijos tipas, kuriame flavininė benzeno monooksigenazė atakuoja substratą.

Nukleofilinė ataka

Reakcijos tipas, kuriame cikloheksanono monooksigenazė (Bayer-Villiger) atakuoja substratą.

kAcat

Maksimalus fermento katalizuojamos reakcijos konversijų skaičius (substratas virsta į produktą) per sekundę esant tam tikrai koncentracijai.

Atjungimo reakcija

Reakcija, ribojanti oksigenazių efektyvumą (lėtumas ir silpnumas).

Kofermentų regeneracija

Procesas, skirtas atkurti kofermentų aktyvumą in vitro sistemose.

Biokonversija

Kofermentų regeneracija in vivo, naudojant auginamas ląsteles.

Biotransformacija

Kofermentų regeneracija in vivo, naudojant intaktines (negyvas) ląsteles.

Pravastatinas

Vaistas kraujagyslių ligų gydyme, gaminamas chemoenziminės sintezės būdu, naudojant citochromą P450 (mutantinį).

EC numeriai

Klasifikavimo sistema, skirianti fermentus pagal jų katalizuojamas reakcijas.

Elektronų donoras

Molekulė, atiduodanti elektronus redokso reakcijos metu.

Elektronų akceptorius

Molekulė, priimanti elektronus redokso reakcijos metu.

Hemo grupė

Kofaktorius, naudojamas kai kurių oksidoreduktazių, ypač citochromų, veikloje.

Stereospecifiškumas

Savybė, būdinga nuo NAD+/NADH priklausomoms dehidrogenazėms, kai fermentas veikia tik tam tikrą stereoizomerą.

Izoaloksazino žiedas

Svarbiausia flavininių fermentų reakcijų dalis, kurioje vyksta pagrindiniai virsmai.

Regioselektyvumas

Savybė, kai fermentas katalizuoja reakciją tam tikroje molekulės vietoje.

Intradiolinė dioksigenazė

Fermentas, katalizuojantis aromatinio žiedo atidarymą tarp dviejų viscinalinių hidroksigrupių.

Ekstradiolinė dioksigenazė

Fermentas, katalizuojantis aromatinio žiedo atidarymą šalia dviejų viscinalinių hidroksigrupių.

Katalizinės triados motyvas

Motyvas, būdingas žiedą atidarančioms dioksigenazėms, susidedantis iš dviejų histidinų ir vienos dikarbokslinės aminorūgšties.

Redokso potencialas

Elektronų judėjimo kryptis oksidoreduktazės sistemoje.

Ksenobiotikai

Cheminės medžiagos, kurių nėra natūraliai organizme ir kurias skaido fermentai, tokie kaip P450.

Baeyer-Villiger reakcija

Reakcija, kurią katalizuoja monooksigenazės, pvz., cikloheksanono monooksigenazė.

Citochromai

Hemo turintys baltymai, dalyvaujantys elektronų pernašos grandinėje ir kai kurių oksidoreduktazių veikloje.

Pterinas

Kofaktorius, naudojamas kai kurių monooksigenazių, pvz., tirozino 3-monooksigenazės, veikloje.

Degounies aktyvacija

Procesas, kurio metu oksiduotas flavinas prisijungia elektronus iš NAD(P)H, kurie panaudojami deguonies aktyvacijai.

Mikroaplinka

Aplinka aplink fermentą, galinti varijuoti redokso potencialą (ypač FAD).

Fermentacija

Procesas, naudojamas maisto ir gėrimų gamyboje, susijęs su oksidoreduktazių veikla.

Biojutikliai

Technologijos, naudojamos gliukozės kiekiui nustatyti, dažniausiai pritaikant gliukozės oksidazės fermentą.

Translokazės

Fermentų klasė, katalizuojanti molekulių pernašą.

Ligazės

Fermentų klasė, katalizuojanti dviejų molekulių sujungimą.

Izomerazės

Fermentų klasė, katalizuojanti vidumolekulinius virsmus.

Liazės

Fermentų klasė, katalizuojanti grupės pernašą/nuėmimą susidarant dvigubiems ryšiams (be vandens).

Hidrolazės

Fermentų klasė, katalizuojanti hidrolizės reakcijas.

Transferazės

Fermentų klasė, katalizuojanti grupių pernašą.

Chiminotripsinas

Hidrolazė, atakuojanti peptidinį ryšį serino peptidazės pavadinimas.

Subvienetas

Struktūrinė dalis, sudaranti sudėtingesnį fermentą, pvz., oksigenazės.

Metalụ jonai

Kofaktoriai, naudojami dioksigenazėsę aktyvindami deguonį (geležis, manganas nikelis).

Riskės tipo geležis

Geležies tipas kofaktorius dioksigenazėsę aktyvindami deguonį ([2Fe-2S] geležies-sieros klasteris).

Hemas

Pagrindinis kofaktorius kai kuriose dioksigenazėsę aktyvindami deguonį.

Intaktinės ląstelės

Ne pažeistos ir funkcionalus ląstelės naudojamos biotransformacijos proceso įgyvendinimų.

Oksidacijos laipsnis

Kofaktoriaus savybė skiriasi tarp intradiolinės ir ekstradiolinės dioksigenzes.

Reduktorai

Molekulė, kuri atiduoda elektronus ir oksiduojasi cheminės reakcijos metu..

Oksidatoriai

Molekulė, kuri pasiema electronus ir redukuojasi cheminės reakcijos metu.

Atvirkštinės reakcijos

Reakcijos, kurios gali vykti abiems kryptimis, priklausomai nuo aplinkybių.

Kvati̇pavimo Grandinė

Serija baltymų, kurie perkeli electronus į elektronų akceptorius, tokius kaip deguonis, kad suformuotų vandenį.

Hidrido Jonas

Negatyviai įkrautas vandenilius atomas.

Nuo kofaktorių nepriklausomos oksigenazės

Degounios aktyvinimo, nereikalauja jokio kofermento.

Uncoupling reakcija

Reakcija, kuri neprivalomai nesukuriama pageidaujamą produktą.

HAPMO

resting cells of, enantioselective Baeyer-Villiger monooxygenase