12 tema

RNR brendimas

Splaisosoma

splaisingo mašina, ribonukleoproteinas

Kokios dalelės sudaro splaisosomą?

5 snRNP

snRNP dalelių sudėtis

Savita U snRNR molekulė, 7 Sm baltymai

Sm baltymai

Visose dalelėse jų toks pats rinkinys, dalyvauja splaisingo valdyme, turi įnašos į branduolį signalą, palaiko snRNP integralumą.

U snRNR molekulės

• Įgyja savitą antrinę ir tretinę struktūrą; • Tiesiogiai dalyvauja atpažįstant splaisingo sritis; • Dalyvauja introno skėlimo ir egzonų jungimo reakcijoje;• Yra susijungę su baltymais snRNP dalelėse.

Montuojantis splaisosomai ir vykstant splaisingui, susidarantys tarpiniai kompleksai

E→A→B→Bact →B* → C →C* →P →ILS

B*

Kataliziškai aktyvintas kompleksas

C

I-os katalizinės reakcijos kompleksas

C*

II-os katalizinės reakcijos kompleksas

Splaisingo trans veiksniai

SR šeimos baltymai, heterologiniai branduolio baltymai, hnRNP.

Splaisingo chemija

dvi trans esterinimo reakcijos

E kompleksas

U1 snRNP jungiasi ties egzono, U2AF (heterodimeras) ir SF1 jungiasi prie polipirimidinų ruožo ir 3’ splaisingo srities, ATP nereikia

A kompleksas

U2 snRNP dalelė jungiasi ties šakojimosi sritimi, reikia ATP, išstumiamas adenino nukleotidas (A)

B kompleksas

Į splaisosomą įsijungia U5 ir U4 / U6 snRNP dalelės

B act vykstantys RNR-RNR sąveikų pokyčiai

• Disocijuoja U1 snRNP; • Suardomas U4-U6 snRNR dupleksas; • Susidaro naujos snRNR sąveikos; • Disocijuoja U4 snRNP

Splaisosomos aktyvusis centras

Metalo jonai M1 ir M2 prijungiami splaisosomos aktyviajame centre. Metalo jonas M2 dalyvauja aktyvinant nukleofilą I-ai, reakcijai, M1 jonas – 2-ai trans esterinimo reakcijai.

Prp8 baltymo vaidmuo

Didžiausias ir konservatyviausias U5 snRNP baltymas. Baltymo domenai sąveikauja ir su kitais splaisosomos komponentais per splaisingą

Kodėl yra alternatyvusis splaisingas?

transkriptomos ir proteomos įvairovės priežastis

Alternatyviam splaisinge, kur intronai yra paliekami?

augaluose, grybuose, pirmuonyse

Alternatyviam splaisinge, kur yra šalinami intronai kartu su egzonais?

aukštesniuosiuose eukariotuose

ESE

egzoniniai splaisingo stiprikliai

ISE

introniniai splaisingo stiprikliai

ESS

egzoniniai splaisingo slopikliai

ISS

introniniai splaisingo slopikliai

Splaisingo veiksniai

• SR baltymai; • hnRNP ribonukleoproteinai; • kiti nežinomi veiksniai.

Egzoniniai splaisingo stiprikliai (ESE) ir slopikliai (ESS)

• Dauguma stipriklių prijungia SR baltymus; • Dauguma slopiklių prijungia hnRNP.

Introniniai splaisingo stiprikliai (ISE) ir slopikliai (ISS)

• Prijungia NOVA šeimos splaisingo veiksnius (ISE); • Prijungia hnRNP (ISS).

SR (Ser-Arg) šeimos baltymai

daug Arg ir Ser (RS / SR pasikartojimai) C-gale, turi prijungiantį domeną RRM, jie atpažįsta cis sekas pre-iRNR molekulėse: egzoninius splaisingo stipriklius, ESE

hnRNP

Heterologiniai branduolio baltymai

Kas yra Heterologiniai branduolio baltymai?

Įvairūs baltymai, prisijungiantys prie pre-iRNR arba iRNR, per transkripciją arba po transkripcijos ir darantys įtaką splaisingo eigai

Splaisingo kelio pasirinkimas

Egzonų nustatymas ir Intronš nustatymas

Egzonų nustatymas

Splaisosoma susimontuoja ties egzonais. Vyrauja žmoguje, pelėje

Intronų nustatymas

Splaisosoma susimontuoja ties intronais. Vyrauja bestuburiuose, augaluose, grybuose

RNR redagavimas

Tai per transkripciją arba po transkripcijos vykstantys RNR transkripto nukleotidinės sekos keitimai, kuriais keičiamas RNR užkoduotos biologinės informacijos turinys.

Pagrindiniai RNR redagavimo tipai

Nukleotidų keitimas, sekų įterpimas (insercijos), sekų pašalinimias (delecijos)

Adenozino deaminazė

Atranki RNR duplekso atžvilgiu

RNR gidai (gRNR)

Įterpimo ir pašalinimo mechanizme dalyvauja 50–80 nt ilgio RNR molekulės

Redagavimas vyksta dalyvaujant baltymų kompleksui

editosomai

Transliacija

paskutinis biologinės informacijos perdavimo iš DNR etapas

Kodonas

Trijų nukleotidų seka iRNR molekulėje lemia amino rūgštį

Termiancijos kodonai

STOP kodonai

Iniciacijos kodonas

AUG – metioninas

STOP kodonai

UAA, UGA ir UAG

Perkodavimo fenomenas

nuokrypis nuo genetinio kodo

Selenocisteinas, Sec (U)

svarbi fermentų aktyvumui;

Sec koduoja ką?

UGA kodoną dėka perkodavimo

UGA kodonas koduoja?

L-piroliziną (ne transliacijos terminacijos kodonas)