Biologie Cellulaire et Moléculaire - La Transcription et l'ARN

Flashcards de vocabulaire fondées sur le cours théorique 5 de Biologie Cellulaire et Moléculaire concernant la structure de l'ARN et le processus de transcription.

Uracile

Base azotée pyrimidique présente dans l'ARN (RNA) en substitution de la thymine (DNA) et s'appariant avec l'adénine.

Structure secondaire du RNA

Conformation tridimensionnelle adoptée par le monobrin de RNA lorsqu'il s'enroule sur lui-même en formant des boucles (loops) stabilisées par des liaisons hydrogène intrabrin.

mRNA (RNA messager)

Molécule de RNA copiée à partir d'un gène du DNA servant d'intermédiaire d'information pour déterminer la séquence des acides aminés des protéines.

rRNA (RNA ribosomal)

Composant majeur des ribosomes (environ $90\%$) constituant leur portion structurale et participant à la synthèse des protéines.

tRNA (RNA de transfert)

Molécule adaptatrice dans la traduction qui sélectionne les acides aminés et les positionne au site adéquat du ribosome pour leur incorporation dans les protéines.

snRNA (small nuclear RNA)

Type de petit RNA nucléaire impliqué dans le processus d'épissage (splicing) pour l'élimination des introns des pré-mRNAs.

scRNA (small cytoplasmic RNA)

Type de petit RNA cytoplasmique impliqué dans l'adressage des protéines au niveau du cytoplasme.

Dogme central de la biologie moléculaire

Principe décrivant le transfert de l'information génétique du DNA au RNA par la transcription, puis du RNA à la protéine par la traduction.

RNA polymérase

Enzyme responsable de la transcription qui déroule le double brin de DNA et catalyse la formation des liaisons phosphodiester reliant les rNTPs dans le sens $5' \rightarrow 3'$.

Bulle de transcription

Structure formée par la RNA polymérase séparant environ $14$ paires de bases de DNA ("complexe ouvert") pour rendre les bases accessibles à l'appariement avec les rNTPs.

Promoteur

Séquence de nucléotides spécifique située en amont d'un gène, reconnue par la RNA polymérase pour débuter la transcription et déterminer le brin modèle ainsi que le sens de synthèse.

Région $-10$ (Boîte TATAAT)

Séquence consensuelle du promoteur procaryote, riche en A-T et également appelée boîte de Pribnow, au niveau de laquelle la RNA polymérase se lie et sépare les deux brins de DNA.

Région $-35$ (Séquence TTGACA)

Séquence consensuelle du promoteur procaryote située en amont du site d'initiation, reconnue initialement par la RNA polymérase.

Facteur Sigma ($\sigma$)

Sous-unité de la RNA polymérase bactérienne responsable de la reconnaissance spécifique de la séquence du promoteur, libérée après la synthèse de $\pm 10$ nucléotides de RNA.

Structure en hairpin (épingle à cheveux)

Structure secondaire formelle du RNA créée par une région riche en G-C suivie de résidus d'uracile, constituant le signal de terminaison de la transcription chez les procaryotes.

Opéron

Ensemble de gènes contigus et fonctionnellement liés chez les procaryotes, contrôlés de façon coordonnée et exprimés sous forme d'un seul RNA messager polycistronique.

ARNm polycistronique

ARN messager propre aux procaryotes contenant les informations codantes pour la synthèse de plusieurs protéines différentes à partir d'un unique transcrit.

ARNm monocistronique

ARN messager typique des eucaryotes ne contenant l'information que pour la synthèse d'une seule protéine.

RNA polymérase II

Enzyme eucaryote qui transcrit la grande majorité des gènes eucaryotiques, y compris tous ceux qui codent pour les protéines.

Facteurs généraux de transcription

Grand ensemble de protéines accessoires chez les eucaryotes qui doivent s'assembler au niveau du promoteur avec la polymérase avant l'initiation de la transcription.

Brin codant (brin sense)

Brin de DNA non utilisé comme modèle pendant la transcription, servant par convention à présenter la séquence d'un gène car sa séquence est identique à celle du RNA produit (avec T au lieu de U).