Buňka - transkripce

Co je to transkripce?

přepis úseku DNA na RNA

fáze transkripce

1. iniciace 2. elongace 3. terminace 4. postrasnkripční modifikace

Co je to promotor?

sekvence DNA, na kterou se navazují transkripční faktory a RNA polymeráza

transkripční faktory

roteiny se schopností spouštět či regulovat transkripci

Jaké známe typy promotorů pro mRNA?

tata, caat, gc

Co je to RNA polymeráza?

enzym, který podle vlákna DNA syntetizuje k němu komplementární vlákno RNA z volných nukleových bází uvnitř jádra

Jaký je rozdíl v navazování na promotor mezi eukaryotickými a prokaryotickými buňkami?

u eukaryotických se na promotor nejdříve naváže transkripční faktor a až na něj RNA polymeráza, zatímco prokaryotická RNA polymeráza se dokáže na DNA navázat sama

Co vytváří RNA polymeráza I?

většinu rRNA

Co vytváří RNA polymeráza II?

mrna a snrna

Co vytváří RNA polymeráza III?

trna, snrna a rrna

Co je to enhancer a silencer?

enhancer = sekvence DNA katalyzující transkripci, silencer = sekvence DNA tlumící transkripci

Jak mohou enhancer nebo silencer ovlivňovat promotor, když se nenacházejí v jeho bezprostřední blízkosti?

navázání transkripčních faktorů na ně způsobuje změnu prostorového uspořádání DNA

Jak probíhá elongace při transkripci?

rna polymeráza otevře a rozmotá DNA a stabilizuje pracovní vlákno, které čte od 3´ do 5´ konce, ale RNA poskládá od 5´ do 3´ konce

Jak probíhá terminace transkripce?

jakmile RNA polymeráza poskládá polyadenylační signál aauaaa, specifické enzymy ho rozeznají a odštěpí RNA od RNA polymerázy

probíhají postranskripční modifikace u prokaryotických buněk?

ne

Jaké postranskripční modifikace probíhají na koncích mRNA?

na 5ˇ konec je několika enzymy přidán 7-methylguanosin neboli (guanosinová čepička) a na 3´ konec je poly(a) polymerázou přidána dlouhá řada adeninových nukleotidů (poly(a) ocas)

K čemu slouží guanosinová čepička a poly(a) ocas?

chrání před rozkladem nukleázami, podílejí se na transportu z jádra a spuštění translace

Co jsou to introny a exony?

introny = části genu nekódující žádné aminokyseliny a exony = části genu kódující aminokyseliny

Co je to spliceozom a jeho funkce?

komplex tvořený snrnp, poskládá se okolo sekvencí na intronu, čímž pobízí k chemické reakci

Co je to snRNP?

snRNA s několika proteinovými podjednotkami

Jaké jsou sekvence pro sestřih?

hranice mezi intronem a exonem na 5´ konci = gu, na 3´ konci = ag a uvnitř intronu je adenin

Jak probíhá chemická reakce při sestřihu intronu?

GU a A spolu vytvoří fosfodiesterovou vazbu a intron se lasovitě stočí, čímž odhalí 3´ konec 1. exonu, který vytvoří fosfodiesterovou vazbu s 5´ koncem 2. exonu

Jaká onemocnění jsou způsobena poruchou splicingu?

spinální svalová atrofie a beta talasemie