wstęp do analizy oddziaływań

dlaczesgo podstawowe oddziaływania sa kluczowe?

-podstawa interakcji leku z celem biologicznym

-decydują o oddziaływaniu lekó ze środowiskiem organizmu

jak dzielimy oddziaływania?

specyficzne i niespecyficzne

jakie amy oddziaływania specyficzne?

jonowe

wodorowe

halogenowe

kation-pi

aromatyczne(pi stacking)

jaką mamy charakterystykę oddziaływania jonowego?

-najsilniejsze

-silniejsze w środowisku hydrofobowym

-spadek siły z objetością jest mniejszy niż w innych wiązaniach

-bezkierunkowe

-kluczowe dla oddziaływań międzybiałkowych

-między grupami o przeciwnych ładunkach

jaka jest charakterystyka wiązań wodorowych?

-między oh lub nh

-hbd to cząsteczka z h a hba to cząsteczka z wolnymi elektronami

-dłuższe niż kowalencyjne

-kierunkowe(najlepiej kąt 180, przy 90 już słabo)

-siły zależą od właściwości elektronowych oddziałująccyh grup

które ukłądy mają mocniejsze a które słabsze oddzialywania wodorowe?

jaka jest charakterystyka wiązań halogenowych?

wokół haolegnu tworzy się sigma dziura z dodatnim ładunkiem co daje miejsce na elektrony od innych atomów

-między C-X a n/o/pi elektrony

-filozowia jak w wiązaniach H, porównywalnie silne

-kierunkowe

-siła zalezy od właściwpsći elektronowych grup

F<Cl<Br<I

-akceptorami są C=O szkieletu peptydowego oraz OH łańcuchów bocznych

-donory z leku

jaka jest charakterystyka oddziaływania kation-pi?

-między monopolem(kation) a kwadrupolem(pi)

-powierzchnie pierścienai sa bogate w elektrony, brzegi bardzo słabo

jaka jest charakterystyka oddziaywań aromatycznych?

inaczej pi-pi

-prostopadłe(T) nazywane CH-pi

równoległe i kanapkowe pi-pi, są najkorzystniejsze

-kanapkowe słabsze od równoległego

jakie mamy oddzialywania niespecyficzne?

odpychające

van der Waalsa

jaka jest charakterystyka oddziaływań odpychających

-wynikają z zakazu Pauliego przy nakłądaniu się orbitali molekularnych

-odpychanie ładunków jednoimiennych

jaka jest charakterystyka sił van der Waalsa?

-słabsze

-addytywne

-nie ulegają wysyceniu

-bezkierunkowe

-bliskiego zasięgu

-niezalezne od temperatury(poza dipol-dipol)

co zaliczamy do sil van der Waalsa?

-wszystkie odziaływania międzycząsteczkowe inne niż jonowe i wodorowe

-głównie siły dyspersyjne Londona między dipolami indukowanymi natychmiastowo i siły Debye;a między dipolem stałym a indukowanym oraz siły Keesoma między dwoma dipolami stałymi

jaka jest charakterystyka sil Londona?

-istotne między hydrofobowymi regionami

-mogą miec duże znaczenie w oddziaływania lek-cel

-ich wypadkowa z silnymi oddzialywaniami odpyhającymi determinuje powierzchnię molekularna a więc kształ ligand ai miejsca wiążącego

-im większe chmura elektronowa i powierzchnia styku tym silniejsze

pierścienie>nierozgałęzion>rozgałęzione

nasycone>nienasycone