Liaisons peptidique et chaines peptiques

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11 Terms

1
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La chaîne peptidique : Polymère d’AA

= enchaînement d’acide aminé


  • Entre le COOH d’un AA et le NH2 d’un autre AA

    = lecture dans le sens N-term vers C-term

  • Les AA sont reliés entre eux par une liaison covalente (liaison peptidique)

  • Entraîne la libération d’une molécule d’eau H2O


2
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Propriété physico-chimique

= déterminée par la propriété physico-chimie des chaînes latérales

R = partie caractéristiques de la protéine


3
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Peptide ou oligopeptide

10 à 20 AA

4
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Polypeptide

de 50 à 100 AA

5
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Protéine

plus de 50 à 10 AA

= peut aussi être formé d’un assemblage supramoléculaire de plusieurs chaînes polypeptidiques

6
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Liaison peptidique : Plan

= 6 atomes = coplanaires C, H, N et O des 2AA reliés

On parle d’unité peptidique


<p>= 6 atomes = coplanaires C, H, N et O des 2AA reliés </p><p>On parle d’unité peptidique</p><p></p>
7
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Liaison peptidique : 2 configurations

  • Trans

  • Cis


8
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Trans

= angle de torsion oméga = 180° (autour de l’axe C-N)

= les chaînes latérales sont de part et d’autres du plan

= plus favorable (point de vue energétique)



<p>= angle de torsion oméga = 180° (autour de l’axe C-N)</p><p>= les chaînes latérales sont de part et d’autres du plan</p><p>= plus favorable (point de vue energétique)</p><p></p><p></p>
9
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Cis

= angle de torsion oméga = 0° (autour de l’axe C-N)

= les chaînes latérales sont du même côté du plan


<p>= angle de torsion oméga = 0° (autour de l’axe C-N)</p><p>= les chaînes latérales sont du même côté du plan</p><p></p>
10
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Changement de direction : Cas de la proline

  • Présence de l’hétérocycle pyrrolidine

    = adopte les 2 configurations (trans et cis)

    = ce qui induit un changement de direction

  • Est souvent observer dans les boucles des protéines




11
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Conformation régulière

  • Angle entre les plans successifs = définis le repliement dans l’espace

  • Rotation possible :

    = phi : entre NH et C

    = psi : entre C et CO


<ul><li><p>Angle entre les plans successifs = définis le repliement dans l’espace</p></li><li><p>Rotation possible :</p><p>= phi : entre NH et C</p><p>= psi : entre C et CO</p></li></ul><p></p>