Tauhan ng El Fili

Simoun

Ang mayamang mag-aalahas at misteryosong tagapayo ng Kapitan Heneral. Siya ay walang iba kundi si Crisostomo Ibarra ng Noli Me Tangere na nagbalik pagkaraan ng 13 taon.

Basilio

Ang nakaligtas na anak ni Sisa sa Noli. Ngayon ay isang mahusay na mag-aaral ng medisina. Sa simula ay ayaw niyang makialam sa pulitika, ngunit nagbago ang isip nang apihin ang kaniyang kasintahan at pamilya.

Isagani

Isang makata, idealistiko, at matapang na pamangkin ni Padre Florentino. Kasintahan ni Paulita Gomez. Siya ang sumasagisag sa mga kabataang may mataas na pangarap para sa bayan ngunit nadadala ng emosyon (siya ang sumira sa plano ng pagsabog ni Simoun upang iligtas si Paulita).

Makaraig

Ang mayamang pinuno ng mga mag-aaral na nagsusulong para sa pagpapatayo ng Akademya ng Wikang Kastila.

Placido Penitente

Isang matalinong mag-aaral na nawalan ng ganang mag-aral dahil sa bulok, mapanglait, at hindi patas na sistema ng edukasyon ng mga prayle.

Kapitan Heneral

Ang pinakamataas na pinuno ng Pilipinas. Gahaman sa kapangyarihan at madaling mamanipula ni Simoun dahil sa kaniyang hilig sa sugal at luho.

Don Custodio

Ang opisyal na pinagkatiwalaang magpasya sa panukala ng mga mag-aaral para sa Akademya. Kilala sa palayaw na "Buena Tinta" ngunit sa katotohanan ay tamad, mapagpanggap, at walang alam sa kaniyang mga pinapasyahang batas.

Ben Zayb

Isang manunulat o mamamahayag na Espanyol na hindi patas mag-ulat. Palagi niyang pinapaboran ang mga Kastila at ginagawang bayani ang mga ito sa kaniyang mga artikulo.

Padre Camorra

Ang bastos at mapagsamantalang kura ng Tiani. Siya ang dahilan ng pagpapakamatay ni Huli.

Padre Irene

Ang paring kaanib ng mga mag-aaral sa pagpapatayo ng Akademya, ngunit may lihim na pansariling interes at traydor sa kaniyang mga pinangakuan.

Padre Fernandez

Ang pambihirang Dominikong propesor na bukas ang isip at handang makinig sa mga hinaing ng mga mag-aaral (tulad ni Isagani).

Padre Florentino

Isang mabuti, marangal, at pilosopong paring Pilipino. Sa kaniya nangumpisal si Simoun bago ito mamatay, at siya ang nagtapon ng kayamanan ni Simoun sa dagat upang hindi na ito magamit sa kasamaan.

Kabesang Tales

Isang masipag na magsasaka na naging Kabesa de Barangay. Inagaw ng mga prayle ang kaniyang lupain sa pamamagitan ng pagpapataw ng mataas na buwis. Nang mapuno, siya ay nagrebelde at naging tulisan sa ilalim ng pangalang Matanglawin.

Tandang Selo

Ang matandang ama ni Kabesang Tales at lolo nina Huli at Tano. Sa tindi ng hapis nang mawala ang kaniyang pamilya, siya ay napipi.

Huli / Juli

Ang mapagmahal na kasintahan ni Basilio at anak ni Kabesang Tales. Nagpaalipin upang matubos ang ama, at kalaunang nagpakamatay sa pamamagitan ng pagtalon sa bintana ng kumbento upang takasan ang panggagahasa ni Padre Camorra.

Paulita Gomez

Ang maganda at mayamang pamangkin ni Donya Victorina. Kasintahan ni Isagani ngunit piniling pakasalan ang mayamang si Juanito Pelaez para sa mas maginhawang buhay.

Donya Victorina

Ang Pilipinang pilit nag-aanyong Espanyola (mula pa sa Noli). Sa nobelang ito, hinahanap niya ang kaniyang nagtatagong asawa na si Don Tiburcio.

Quiroga

Isang mayamang mangangalakal na Tsino na naghahangad maging konsul. Sa kaniyang bodega itinago ni Simoun ang mga baril at bala para sa himagsikan.