Transcription

Synonyme ARN primaire

• ARN hétéronucléaire

• ARNhn

Par quoi est dicté le choix du brin d’ADN pour la transcription ?

Par la séquence du promoteur

Quelles sont les conventions utilisées pour noter les différents brins?

• Brin matrice → Brin -

• Brin codant → Brin +

Qu’est ce que l’ARN polymérase?

• Une enzyme capable de se lier à l’ADN

Role ARN polymérase

• Catalyse de la réaction de polymérisation des ribonucléotides

• Permet séparation des deux brins d’ADN sur une courte zone

Quelles sont les 4 sous unités de l’ARN polymérase procaryote ?

• σ

• Alpha et bêta

• Bêta’

Caractéristiques sous unité σ ARN polymérase procaryote

• Reconnaissance du promoteur

• Différents types

• Permet régulation de l’expression de certains gènes

Caractéristiques sous unité alpha et bêta ARN polymérase procaryote

• Liaison à l’ADN

Caractéristiques sous unité beta’ ARN polymérase procaryote

• Site catalytique → site actif élongation

Quels sont les ARN synthétisés par l’ARN polymérase procaryote ?

• ARNm

• ARNt

• ARNr

Structure ARN polymérase eucaryotes

• 5 à 10 sous unités (2 sous unités majeures)

• Polymérase II : extrémité carboxy terminale CTD

Que réalise l’ARN polymérase I et ou ?

• Synthèse des ARNr : 5,8S, 18S, 28S

• Dans le nucléole = sous compartiment du noyau

Que réalise l’ARN polymérase II et ou ?

• Synthèse des ARNm

• Dans nucléoplasme

Que réalise l’ARN polymérase III et ou ?

• Synthèse des ARNt et de l’ARN 5S

• Dans nucléoplasme

Par quoi est régulée l’activité de l’ARN polymérase?

• Par facteurs généraux de transcription

• Par facteurs régulateurs

Role promoteur

• Recrutement de l’ARN polymérase

• Définition de l’unité de transcription

Quelle est la différence entre les promoteurs procaryotes et eucaryotes ?

• 1 motif de reconnaissance différent :

- Procaryote : TTGACA → -35 pb du début de la transcription

- Eucaryote : CAATCT → -75pb du début de la transcription

Quelles sont les deux étapes de la phase d’initiation chez les procaryotes?

• Reconnaissance du promoteur par l’ARN polymérase

• Dissociation facteur σ

Qui est le facteur nécessaire à la phase d’initiation (reconnaissance du promoteur) chez les procaryotes et pourquoi ?

• Facteur σ nécessaire

• Pour la liaison aux zones -10 et -30 du promoteur

Pourquoi le facteur σ se dissocie t il lors de la phase d’initiation chez les procaryotes ?

• Pour le début de l’étape d’élongation

• Autorisé le mouvement de l’ARN polymérase le long du brin matrice

La phase d’élongation des procaryotes nessecite elle des amorces?

Non, contrairement à l’ADN polymérase

Deux étapes phase de terminaison chez les procaryotes

• Détachement ARN polymérase

• Intervention de séquences terminateur (régions riches en bases C et G)

Étapes phase d’initiation des eucaryotes

1- Reconnaissance motif TATA par TFII-D

2- Recrutement de TFII-A et TFII-B

3- Fixation de l’ARN pol II et facteur TFII-F

4- Phosphorylation de l’ARN pol II

Comment est la phase d’élongation chez les procaryotes ?

• Similaire à celle des eucaryotes

Comment se déroule la phase de terminaison des eucaryotes par l’ARN pol I?

• Intervention de protéines liées à l’ADN : blocage transcription

Comment se déroule la phase de terminaison des eucaryotes par l’ARN pol II?

• Intervention des protéines présentes sur le domaine C terminal : clivage de l’ARN

Quand se déroule la phase de terminaison des eucaryotes par l’ARN pol II?

• Apres transcription du signal de polyadénylation

Comment se déroule la phase de terminaison des eucaryotes par l’ARN pol III?

• Comme pour les procaryotes

Quand sont éliminés les introns ?

Au cours de l’épissage

Les introns sont ils transcrits?

Oui, ce sont des parties transcrites mais non exprimées

Que retrouve t on aux extrémités 5’ et 3’ après la maturation de l’ARN primaire ?

• 5’ → coiffe méthyl guanosine : 7mG

• 3’ → motif polyadényl

Role de la coiffe 7- méthyl Guansosine ?

• Protection et stabilisation extrémité 5’

• Favorise initiation de la traduction

• Migration des ARNm vers cytoplasme

Quelles sont les deux étapes du mécanisme de l’ajout de la coiffe 7 méthyl guanosine ?

1) Réaction de condensation entre ARN et GTP

2) Méthylation du nucléotides accroché à ARN

Role motif poly - A ?

• Protection et stabilisation ARNm

• Motif de reconnaissance pour l’export de l’ARNm hors du noyau

Étape de l’ajout d’un motif poly - A?

• Reconnaissance motif polyadénylation

• Clivage ARNm par une endonucléase spécifique

• Action poly - A polymérase à l’extrémité 3’

Qu’est ce que le spliceosome et quel est sont rôle ?

• Macrocomplexe de ribonucléotides = snRNP

• Épissage de l’ARNhn

À quoi est associé le spliceosome lors de l’épissage de l’ARNhn ?

• À des snRNA → Petits ARN nucléaires

Quelles sont les deux bornes lors de l’épissage de l’ARNhn ?

• En 5’ : site donneur → motif GU

• En 3’ : site accepteur → motif AG

Quel est le point de branchement lors de l’épissage de l’ARNhn?

• Adénine

Quelles sont les localisations possibles des mutations de l’ADN et épissage?

• Au niveau site donneur et accepteur

• Au niveau site de branchement

Quelles sont les conséquences des mutations de l’ADN et épissage ?

• Modif constitution ARN

• Modif expression gène

• Maladies génétiques

Citer 4 types d’ARNr eucaryote

• 5S

• 5,8S

• 18S

• 28S

Quelles sont les modifications possibles des ARNr?

• Protection extrémités

• Absence épissage

Caractéristiques protection des extrémités lors des modifications des ARNr?

• Absence de protection en 5’

• Absence de polyadénylation en 3’

Caractéristiques gènes des ARNt

• Souvent regroupés sur un meme chromosome

• Peuvent comporter introns qui subiront un épissage

Quelles sont les deux étapes lors du mécanisme de transcription et de maturation de l’ARN mitochondrial eucaryote ?

1- Transcription primaire

2- Maturation par coupure des ARNt

Que génère la transcription primaire de l’ARN mitochondrial eucaryote ?

• Un grand ARN primaire polycistronique

Qu’est ce qu’un ARN primaire polycistronique ?

• ARN regroupant en une seule unité tous les ARN d’un même brin d’ADN

Que réalise la transcription primaire de l’ARN mitochondrial eucaryote?

• Transcription de la totalité de chacun des deux brins

Par qui est réalisé la maturation par coupure des ARNt de l’ARN mitochondrial ?

• Par des RNases