Caracterización de haplotipos de Caliothrips phaseoli en México

Flashcards de preguntas y respuestas sobre el avance de tesis de caracterización de haplotipos de Caliothrips phaseoli en México.

¿Qué porcentaje de la proteína diaria del mexicano promedio aporta el cultivo de frijol (Phaseolus vulgaris)?

Aporta el $36\%$ de la proteína diaria.

¿Cuál es la producción anual reportada del cultivo de frijol en México según el SIAP (2024)?

Más de $996,392.77$ toneladas producidas anualmente.

¿Qué porcentaje de pérdidas totales en el rendimiento del cultivo de frijol pueden llegar a causar las plagas de trips?

Pueden causar hasta un $90\%$ de pérdida total.

¿Cuáles son las tres principales especies de trips asociadas al cultivo de frijol en México señaladas en la presentación y en qué regiones impactan?

Frankliniella occidentalis (Centro de México, Chihuahua), Thrips tabaci (Morelos, Puebla, Zacatecas) y Caliothrips phaseoli (Sinaloa, Sonora, Nayarit).

¿Qué especie de trips de importancia agrícola se observa en la imagen?

Caliothrips phaseoli

¿Qué marcador molecular se utiliza en el estudio para analizar la diversidad genética y estructura poblacional de Caliothrips phaseoli?

El gen mitocondrial $COI$ (citocromo c oxidasa subunidad I).

¿Por qué razones se seleccionó la región del gen $COI$ como marcador molecular para la investigación?

Por su alta tasa de mutación (variación entre poblaciones), por ser el marcador estándar en la identificación de especies y por su facilidad de amplificación y análisis.

¿Qué hallazgo clave reportó Ribeiro Junior (2022) en Brasil respecto a Caliothrips phaseoli?

Reportó alta homogeneidad genética en poblaciones asociadas a los cultivos de frijol y soya utilizando el marcador $COI$.

¿Cuál es la hipótesis planteada en la investigación sobre la estructura poblacional de Caliothrips phaseoli en México?

La estructura poblacional no es homogénea, sino que presenta una alta diversidad genética constituida por múltiples haplotipos agrupados en distintos grupos genéticos relacionados con el origen geográfico o el hospedante.

¿Cuáles son los cuatro parámetros que se evaluarán para analizar la diversidad genética de Caliothrips phaseoli?

Número de haplotipos ($H$), diversidad haplotípica ($Hd$), diversidad nucleotídica ($\pi$) y sitios polimórficos ($S$).

¿Qué método específico se definió para la construcción de redes de haplotipos de Caliothrips phaseoli?

El método de $TCS$.

¿Cuántas muestras recolectadas/recibidas y cuántos especímenes seleccionados de Caliothrips phaseoli se han registrado en el avance de colectas?

Un total de $118$ muestras recolectadas/recibidas de $74$ sitios de colecta, con $1,216$ especímenes seleccionados de Caliothrips phaseoli.

¿Qué estado aportó el mayor número de individuos seleccionados de Caliothrips phaseoli en los reportes de colecta?

Sinaloa, con $1,036$ especímenes seleccionados de $82$ muestras y $55$ sitios de colecta.

¿Qué kit comercial y qué volumen de elución se emplearon para la extracción de ADN de las muestras?

Kit DNeasy Blood & Tissue (QIAGEN) con un volumen de elución de $45\,\mu L$.

¿Qué par de cebadores (primers) y qué enzima se usaron para la PCR de la región $5'$ del gen $COI$?

Los cebadores LCO1490 / HCO2198 y la enzima Platinum SuperFi II.

De las $46$ muestras de frijol procesadas para PCR-COI, ¿cuántos productos amplificaron y cuántos fueron enviados a secuenciación?

Amplificaron $24$ muestras (todas purificadas) y $19$ productos fueron enviados a secuenciación.

¿Cuál es el porcentaje de avance general acumulado en los objetivos del proyecto?

Un $30\%$ de avance acumulado.