chimie bio-inorganique

Quels sont les caractéristiques des metaux courant dans la nature?

• abondant: sinon il y aura un coup énergétique pour les accumuler

• labiles: nécessaire pour la

fixation des substrates au niveau des sites actifs de métalloprotéines

• thermodynamiquement stable -pour assurer la stabilité biomolécules

pourquoir la homéostasie est elle important?

• Excès → Fe: nécrose

• Déficit →Fe, Co: anémie

→ Mg: crampes

→Mn:stérilité

→cr: diabète

Quels composés bio inorganiques portant une géométrie trigonale plane ?

Cu + hémocyanine, tyrosinase

Quels composés bio inorganiques portant une géométrie tétraédrique ?

Cu2+ : rubrédoxines

Zn2+: anhydrase carbonique, alcool déshydrogènase

Fe2+/3+: ferredoxines

Quels composés bio inorganiques portant une géométrie pyramide à base carré ?

Cu2+: polyphénol oxydase, hémocyanine oxydés

FC27/37: cytochromes: hémoglobine

Mo 4+/5+/6+: sulfite s oxydase, xanthine oxydase

Quels composés bio inorganiques portant une géométrie octaedrique?

Fe3+: complexe de sidérophore, cytochrome, oxygénases

Co 3+ : Vitamine B12, methionine synthase

pourquoi ces géométries sont souvant loin des symétries idéales ?

à cause des contraintes imposés par des matrices biologiques

Quels sont des ligands biologiques ?

acides aminés (protéines)

sucres (glucides)

anions présents dans le milieu

acides nucdéiques(ADN, ATP, ARN, ATP)

acides grasses

cofacteurs

comment des métaux inter agissent avec des acides nucliiques?

interaction avec deux des parties: phosphates+ bases

• phosphates →Mg2+ facilite la dégradation d'ATP Lors de la contraction des muscles

→ coordination aux phosphates reduit la répulsion entre les ans les autres qui facilite l'en roulement d'ADN

• bases: K+ facilite la formation des télomères avec guanine

→ cis platine crée une courbure d'ADN qui impêche sa lecture

comment des métaux interagissent avec des acides aminés

• pour a coordination dans ces sites actifs d'enzymes

• la bio molécule doit être fexible afin d’ utiliser effet de chelate, donc pas tertiaire (carbonyle/amidate)

• canaux membrane: les carbonyle sont des ligands faibles donc le métal peut passer sans être bloqué

• cofacteurs: hémoglobine +Fe et Chlorophylle+ Mg

Quels sont les acides aminés qui sont couramment coordinés?

principalement avec 7:

Asp dur

Glu. ^

Tyr

His

Lys

cys v

Met mou

Quelle est la definition d'un cofacteur?

• un grpt fixant le métal qui peut être enlevé intact de la proétine

métallation est essentielle pour l'addition / l'enlevement à une porphyrine

comment les métaux interagissent-ils avec des ligands inorganiques ?

• magnetite (Fe3 O4) est un boussole naturel synthétisé par des bactéries magnetotactiques lié à la membrane - permet de s'orienter

• ferrodoxines (des centres fer-soufre) sont importants au processus de transfert des électrons

Quels sont les 7 grands roles biochimiques des métaux?

• structure

• transfert des informatique, maintenir la pression osmatique

• catalyse acide-base

• transfert d'électron

• catalyse rédox

• fixation de gaz

• medecine

comment les métaux jouent un rôle structurale?