Biochimie et Biologie Moléculaire - La Traduction Protéique

Flashcards de vocabulaire sur les mécanismes, facteurs et régulations de la traduction protéique.

Liaison peptidique

Liaison covalente s'établissant entre la fonction carboxyle portée par le carbone $\alpha$ d'un acide aminé et la fonction amine portée par le carbone $\alpha$ de l'acide aminé suivant.

Activité peptidyl-transférase

Activité enzymatique portée par l'ARNr de la grosse sous-unité ribosomique (assimilée à un ribozyme) qui catalyse la formation des liaisons peptidiques lors de l'élongation.

Polyribosome (Polysome)

Structure formée par l'assemblage simultané de plusieurs ribosomes sur un même ARNm, permettant d'optimiser et d'amplifier la production de protéines.

Facteur eiF2

Petite protéine G monomérique centrale de l'initiation de la traduction, active lorsqu'elle est liée au GTP et inactive lorsqu'elle est liée au GDP.

Facteur eiF2B

Facteur d'échange de nucléotides guanyliques spécifique qui réactive eiF2 en facilitant l'échange de son GDP contre un GTP.

Site P (Site Peptidyle)

Site du ribosome accueillant l'ARNt aminoacyl-méthionine initiateur au cours de l'initiation, puis l'ARNt lié à la chaîne polypeptidique naissante durant l'élongation.

Site A (Site Aminoacyle)

Site du ribosome recevant le nouvel aminoacyl-ARNt entrant en fonction de la complémentarité de son anticodon avec le codon situé sur l'ARNm.

Site E (Site d'Éjection)

Site du ribosome occupé par l'ARNt déchargé de son acide aminé juste avant son expulsion du complexe ribosomique.

Protéine IRP (Iron Response Protein)

Protéine régulatrice (ou aconitase) sensible au fer, capable de se fixer sur des structures en épingles à cheveux des ARNm pour réguler leur traduction ou leur stabilité.

Ferritine

Protéine de stockage du fer dont la traduction de l'ARNm est bloquée en $5'$ par l'IRP en cas de carence en fer, et autorisée en cas d'excès de fer.

Récepteur de la transferrine

Protéine permettant le captage du fer plasmatique dont l'ARNm est stabilisé en $3'$ par l'IRP en cas de carence en fer, mais dégradé lors d'un excès de fer.

Facteur EF1

Facteur d'élongation (petite protéine G monomérique) associé à l'aminoacyl-ARNt entrant, induisant une courbure temporaire pour permettre le contrôle de qualité de l'appariement codon-anticodon.

Facteurs de relargage

Protéines se fixant sur le site A du ribosome en présence d'un codon STOP, provoquant l'hydrolyse du polypeptide et la dissociation complète du complexe ribosomique.

Complexe de jonction d'exons (EJC)

Complexe protéique déposé à chaque jonction d'intron épissé sur l'ARNm mature, éliminé par le passage du premier ribosome lors d'une traduction normale.

Protéines UPF

Protéines recrutées lors d'un épissage anormal lorsqu'un codon STOP prématuré est rencontré en amont d'un complexe EJC, provoquant la dégradation rapide de l'ARNm.

Ribozyme

Molécule d'ARN dotée d'une activité enzymatique, telle que la grosse sous-unité ribosomique assurant la fonction peptidyl-transférase.

Inhibiteurs de la traduction

Composés (tels que certains antibiotiques) se liant spécifiquement aux sous-unités ou sites actifs du ribosome pour bloquer la synthèse protéique.