🌱🦠 Mikrobiologia - 🔬🌡️ Laby - 🔬🦠 Diagnostyka laboratoryjna pałeczek jelitowych

Computer-friendly

⚪🧫 Kolonie bezbarwne.

Bakterie te (np. Pseudomonas, Shigella) nie rozkładają laktozy (są laktozoujemne), więc nie zmieniają barwy wskaźnika.

❓🎨 Jaki wygląd mają kolonie pałeczek Pseudomonas oraz większości gatunków Shigella na podłożu MacConkeya i z czego on wynika? [2]

Sugestie: Określ kolor kolonii oraz zdolność metaboliczną względem głównego cukru podłoża.

🛑🚷 Hamowanie wzrostu bakterii gramdodatnich.

Dodatkowo podłoża te (szczególnie te do badania kału) w różnym stopniu ograniczają wzrost stale obecnej w jelicie Escherichia coli, co ułatwia znalezienie patogenów.

❓🛡 Jaki jest główny cel stosowania składników wybiórczych w podłożach takich jak SS, HE czy MacConkey? [2]

Sugestie: Wskaż grupę bakterii, których wzrost jest całkowicie blokowany, oraz gatunek, którego namnażanie jest celowo redukowane.

🧪🧬 Barwniki anilinowe, sole kwasów żółciowych oraz tiosiarczan sodu.

Składniki te hamują wzrost flory towarzyszącej (głównie E. coli), pozwalając na wykrycie laktozoujemnych pałeczek chorobotwórczych.

❓🧪 Jakie trzy rodzaje substancji chemicznych zawiera silnie wybiórcze podłoże SS (Salmonella-Shigella)? [3]

Sugestie: Wymień grupy związków chemicznych odpowiedzialnych za wysoką selektywność tego podłoża.

🎯🔬 Yersinia enterocolitica.

Tworzy ona na tym podłożu małe kolonie o średnicy 1–2 mm po odpowiednio długim czasie inkubacji.

❓💉 Do izolacji jakiego gatunku bakterii wykorzystuje się specjalistyczne podłoże CIN i co wyróżnia morfologię tych kolonii? [2]

Sugestie: Podaj nazwę pałeczki wywołującej jersiniozę oraz przybliżoną wielkość jej kolonii.

🎨✨ Ułatwienie i przyspieszenie wstępnej identyfikacji.

Pozwalają one na wizualne odróżnienie drobnoustrojów na podstawie barwnych reakcji enzymatycznych zachodzących bezpośrednio na płytce.

❓🌈 Jaka jest główna zaleta stosowania nowoczesnych podłoży chromogennych w diagnostyce mikrobiologicznej?

Sugestie: Skup się na szybkości diagnozy oraz sposobie, w jaki mikroorganizmy stają się rozróżnialne dla oka.

1. 🧫🍎 Podłoża Levine'a.

2. 🧫🍎 EMB.

3. 🧫🍎Wilsona-Blaira oraz HE.

Wybór zależy od rodzaju badanego materiału klinicznego i poszukiwanego patogenu.

❓📚 Wymień cztery inne podłoża wybiórczo-diagnostyczne stosowane do izolacji patogenów jelitowych wymienione w tekście. [4]

Sugestie: Podaj nazwy własne lub skróty pożywek stosowanych najczęściej przy posiewach kału.

🧼🧬 Cetrimid.

Podłoże to jest wybiórcze dla pałeczek z rodzaju Pseudomonas i dodatkowo stymuluje wytwarzanie piocyjaniny.

❓🛡 Jaka substancja hamująca jest kluczowym składnikiem podłoża selektywnego dla pałeczek Pseudomonas?

Sugestie: Podaj nazwę związku chemicznego, który jest składową nazwy tej pożywki.

🧪🔠 I – indol, M – czerwień metylowa (Methyl Red), Vi – próba Voges-Proskauera (VP), C – wykorzystanie cytrynianu.

❓🧪 Co oznaczają poszczególne litery w akronimie IMViC, stanowiącym zestaw podstawowych testów różnicujących pałeczki jelitowe? [4]

Podaj pełne nazwy czterech testów biochemicznych wchodzących w skład tego szeregu.

🍭🧪 Fermentacja glukozy (w słupku), fermentacja laktozy (na skosie), wytwarzanie gazu oraz produkcja siarkowodoru (H2​S).

❓🧬 Jakie cztery parametry metaboliczne pozwala jednocześnie ocenić podłoże Kliglera podczas identyfikacji pałeczek jelitowych? [4]

Uwzględnij rozkład dwóch rodzajów cukrów, produkt gazowy oraz zmianę zabarwienia związaną z metalem ciężkim.

• 🖤 Salmonella spp.

• 🖤 Citrobacter freundii.

• 🖤 Proteus vulgaris.

• 🖤 Proteus mirabilis.

• 🖤 Edwardsiella tarda.

❓🛢 Które rodzaje i gatunki pałeczek jelitowych zawsze wydzielają siarkowodór (H₂​S) na odpowiednich podłożach, takich jak pożywka Kliglera? [5]

Wymień pięć konkretnych taksonów (rodzajów lub gatunków) zdolnych do czernienia podłoża.

• 🔴 Klebsiella spp.

• 🔴 Enterobacter spp.

• 🔴 Hafnia spp.

• 🔴 Pantoea spp.

• 🔴 Serratia spp..

❓🧨 Dla jakich rodzajów bakterii jelitowych dodatnia próba Voges-Proskauera (VP), oznaczająca rozkład glukozy do acetoiny, jest cechą charakterystyczną? [5]

Wymień pięć rodzajów bakterii, które dają pozytywny wynik tego testu.

• 🧪 Proteus spp.

• 🧪 Morganella spp.

• 🧪 Providencia spp.

❓🧪 Które rodzaje pałeczek jelitowych posiadają unikalną zdolność do deaminacji fenyloalaniny? [3]

Skup się na trzech rodzajach bakterii, które są blisko spokrewnione i często izolowane z zakażeń układu moczowego.

• 🚶‍♂‍➡️ Shigella spp.

• 🚶‍♂‍➡️ Klebsiella spp.

• 🚶‍♂‍➡️ Yersinia spp.

  • 🌡 Przy czym Yersinia spp. wykazuje ruch w temperaturze 22°C.

❓⏱ Które rodzaje pałeczek jelitowych są nieruchliwe w temperaturze 36°C i który z nich staje się ruchliwy po obniżeniu temperatury do 22°C? [4]

Wymień trzy rodzaje nieruchliwe w temperaturze ciała oraz wskaż ten, który zmienia swój fenotyp ruchu.

🔵🚫 Enterobacterales są oksydazo-ujemne.

🔵✅ Pseudomonas spp. są oksydazo-dodatnie.

❓🔬 Jaki wynik testu na oksydazę cytochromową pozwala odróżnić pałeczki jelitowe od tlenowych pałeczek niefermentujących z rodzaju Pseudomonas? [2]

Podaj wynik (dodatni lub ujemny) dla obu tych grup bakterii.

🧬🔬 API (panel miniaturowych prób biochemicznych) oraz MALDI-TOF MS (spektrometria mas).

❓⚙ Jakie nowoczesne metody są obecnie stosowane do sprawnej i szybkiej identyfikacji pałeczek jelitowych, zastępując tradycyjne testy w probówkach? [2]

Podaj skrótową nazwę komercyjnego zestawu testów oraz nazwę techniki wykorzystującej laser i detektor masy jonów.

🧪🗂 API (ang. Analytical Profile Index). Jest to panel zminiaturyzowanych prób biochemicznych. Stanowi duże ułatwienie zwłaszcza w identyfikacji pałeczek izolowanych z infekcji pozajelitowych.

❓🔬 Jak nazywa się komercyjny zestaw zminiaturyzowanych testów biochemicznych i kiedy jest on szczególnie pomocny?

Sugestia: Podaj skrótową nazwę metody oraz wskaż rodzaj zakażeń, w których ułatwia ona diagnostykę.

⚡⚛ Spektrometria mas MALDI-TOF MS. Pozwala na sprawną i bardzo szybką identyfikację pałeczek jelitowych na podstawie ich profilu białkowego.

❓📉 Jaka nowoczesna technika fizykochemiczna zapewnia obecnie najsprawniejszą identyfikację pałeczek jelitowych w rutynowej pracy laboratorium?

Sugestia: Podaj pełną nazwę techniki wykorzystującej pomiar masy cząsteczek.

🎭🧬 Metoda ta zawodzi przy różnicowaniu rodzaju Shigella oraz gatunku Escherichia coli. Wynika to z ich ogromnego podobieństwa genetycznego (ponad 99% homologii).

❓🛑 W przypadku których dwóch blisko spokrewnionych rodzajów bakterii spektrometria mas MALDI-TOF MS okazuje się niewystarczająca?

Sugestia: Wskaż dwa taksony, które są niemal identyczne pod względem filogenetycznym.

🧬🧺 Multiplex-PCR. Pozwala ona na jednoczesne wykrywanie genów charakterystycznych dla różnych grup biegunkowych w jednej reakcji.

❓🧪 Jaką odmianę techniki PCR stosuje się do jednoczesnego wykrywania pięciu podstawowych grup biegunkowych DEC?

Sugestia: Podaj nazwę wariantu reakcji amplifikacji DNA wykorzystującej wiele par starterów.

🧬🔍 Poszukiwane geny to:

• 🧴 esta i elta (dla ETEC);

• 🏗 eae (dla EPEC);

• 🩸 vtx1 i vtx2 (dla EHEC/STEC);

• 🗡 ipaH (dla EIEC);

• 🧱 aafA, aggR, aaiC (dla EAEC).

❓🧬 Wymień geny identyfikujące poszczególne serotypy biegunkowe E. coli w zestawach diagnostycznych. [5]

Sugestia: Przypisz konkretne skróty genów (toksyn lub adhezyn) do pięciu głównych grup patotypów DEC.

🌳🔢 Metoda MLST (ang. Multilocus Sequence Typing) oraz WGS (ang. Whole Genome Sequencing - sekwencjonowanie całych genomów).

❓🗺 Jakie techniki genetyczne są wykorzystywane do celów epidemiologicznych (np. dochodzenia źródeł epidemii)? [2]

Sugestia: Wymień skróty metod pozwalających na precyzyjne ustalenie pokrewieństwa między izolatami.

🧬🎯 Gen uidA. Odpowiada on za wytwarzanie enzymu β-glukuronidazy (GUD), który występuje u 97% szczepów E. coli.

❓🧬 Wykrycie jakiego genu pozwala odróżnić Escherichia coli od innych gatunków z tego rodzaju i od innych pałeczek jelitowych?

Sugestia: Podaj nazwę genu oraz enzymu, za którego produkcję odpowiada.