Mikrobiologiska termer

Adhesin

Molekyl som hjälper en mikroorganism att fästa vid celler eller ytor.

Aerob

Kräver eller använder syre

Aerotaxis

Rörelse mot eller bort från syre.

Aktivitetsspektrum

Vilka mikroorganismer eller organismer ett ämne (ofta läkemedel) är verksamt mot.

Amensalism

Negativ och neutral påverkan

Anabolism

Uppbyggnad av komplexa molekyler från enklare ämnen; kräver ofta energi.

Anaerob

Kan leva eller verka utan syre.

Anoxygen fotosyntes

Fotosyntes som inte producerar syre.

Antigenisk drift

Små genetiska förändringar (mutationer) som gradvis förändrar virusets antigen.

Antigeniskt skifte

En större förändring av virusets antigen, exempelvis genom blandning av genetiskt material. Kan skapa nya versioner av viruset.

Antiseptika

Ämnen som dödar eller hämmar mikroorganismer på levande vävnad.

Archaellum

Rörelseorgan hos arkéer.

Ascus (pl. asci)

Sporsäck hos säcksvampar där sexuella sporer bildas.

Asymmetrisk celldelning

Dottercellen som växer ur modercellen är mindre. Ex. budding.

Autoinducer

Signalmolekyl som mikroorganismer använder vid quorum sensing.

Autoklavering

Sterilisering med vattenånga under högt tryck och hög temperatur (121°C)

Autotrof

Organism som använder koldioxid som huvudsaklig kolkälla.

Auxotrof

Organism som behöver få ett essentiellt ämne från omgivningen (har inte eller har förlorat förmågan att syntetisera det själv).

Avknoppning

En form av asymmetrisk celldelning. Asexuell förökning där en ny cell eller organism växer ut från modercellen.

Axenisk

Ett rent prov. Innehåller endast organismer med identiskt genom.

Bacillus (pl. bacilli)

Stavformad bakterie.

Bakteriofag

Virus som infekterar bakterier.

Basidiocarp

Fruktkropp hos basidiesvampar.

Basidium (pl. basidia)

Struktur hos basidiesvampar där sexuella sporer bildas.

Binär fission

Celldelning där en cell blir två dotterceller.

Biofilm

Samhälle av mikroorganismer som fäster vid en yta och omges av en egenproducerad matris.

Bright-field-mikroskopi

Ljusmikroskopi där provet syns mörkare mot en ljus bakgrund.

Candidatus

Beteckning för en föreslagen mikrobiell art som ännu inte uppfyller alla krav för formell beskrivning (har inte framgångsrikt kultiverats än).

Cilie

Hårliknande struktur som används för rörelse eller för att transportera material längs en cellyta.

Coccus (pl. cocci)

Sfärisk eller klotformad bakterie.

Compatible solute, definition och funktion.

Liten molekyl som hjälper cellen att hantera abiotisk stress utan att störa cellens funktioner. Reagerar inte och inhiberar inte andra cellfunktioner.

Copy number

Antalet kopior av en viss DNA-sekvens, gen eller plasmid i en cell eller ett genom.

Cyanolav

Lav där cyanobakterier fungerar som fotosyntetiserande partner.

Cyst

Vilostadium med ett skyddande hölje som hjälper organismen att överleva ogynnsamma förhållanden. Genomgår inte celldelning eller metaboliska processer.

Deletion

Mutation där en eller flera nukleotider tas bort från DNA.

Denitrifiering

NO₃⁻ -(reduktion)-> N₂

Desinfektion

Behandling som minskar/dödar de flesta mikroorganismer, ej sporer.

Diazatrof

Organism som kan fixera kvävgas (N₂) till biologiskt användbara kväveföreningar.

Diderm

Två cellmembran.

Dimorfisk

Kan förekomma i två olika former, ex. unicellulär och filamentös

Elektronmikroskopi

Mikroskopi som använder elektroner i stället för ljus.

Endobiotisk

Lever inuti en annan organism eller dess vävnad.

Endospor

Mycket tålig spor som bildas av vissa bakterier för att överleva ogynnsamma förhållanden.

Epibiotisk

Lever på utsidan av en annan organism.

Excystering

När en organism lämnar sitt cyststadium och återgår till aktiv form.

Extracellulär matris (ECM)

Material utanför cellerna som de själva producerar; i biofilmer hjälper den cellerna att fästa, bilda struktur, skydda dem, binda vatten, lagrar näringsämnen och möjliggöra signalsubstanser samt genetiskt utbyte mellan cellerna.

Extremofil

Organism som trivs under extrema förhållanden.

Fakultativ

Kan växla mellan olika livssätt eller metaboliska förhållanden.

Fermentation

Energiutvinning utan en extern elektronacceptor.

Flagell

Trådliknande rörelseorgan hos vissa celler.

Flockulering

När små partiklar eller celler klumpar ihop sig till större flockar. Ex. för att undankomma predatorer/ skydda sig från gifter.

Fluorescensmikroskopi

Mikroskopi där fluorescerande ämnen används för att synliggöra specifika strukturer.

Fluorofor

Molekyl som fluorescerar.

Fotoautotrof

Använder ljus som energikälla och koldioxid som kolkälla.

Fotobiont

Fotosyntetiserande partner i en symbios, exempelvis i en lav.

Fotoheterotrof

Använder ljus som energikälla men organiska ämnen som kolkälla.

Fototaxis

Rörelse mot eller bort från ljus.

Fototrof

Använder ljus som energikälla.

Frameshift-mutation

Mutation där antalet insatta (insertions) eller borttagna (deletions) nukleotider förändrar läsramen i en kodande DNA-sekvens.

Gramfärgning

Färgningsmetod som skiljer bakterier åt efter cellväggens egenskaper.

Gramnegativ

Bakterie med en tunnare cellvägg (peptidoglykan) och två cellmembran där det yttre membran består av LPS. Rosa/röd vid gramfärgning.

Grampositiv

Bakterie med en tjock cellvägg (peptidoglykan) och ett cellmembran. Blå/lila vid gramfärgning.

Green fluorescent protein (GFP)

Naturligt fluorescerande protein som används för att märka och följa celler eller proteiner. Kräver genmodifiering.

Halofil

Organism som trivs i miljöer med hög salthalt.

Haploid

Har en uppsättning kromosomer.

Heterocyst

Specialiserad kvävefixerande cell hos filamentösa cyanobakterier.

Heterotrof

Använder organiska ämnen som kolkälla.

Horisontell genöverföring

Överföring av genetiskt material mellan organismer på annat sätt än från förälder till avkomma.

Hyf

Trådformad cellstruktur som bygger upp många svampars mycel.

Hypertermofil

Organism som trivs vid extremt höga temperaturer, ofta över cirka 80 °C.

Insertion

Mutation där en eller flera nukleotider läggs till i DNA.

Kapsid

Proteinhölje som omger virusets genetiska material.

Katabolism

Nedbrytning av molekyler för att frigöra energi och bilda enklare ämnen.

Katalas

Enzym som bryter ner väteperoxid (H₂O₂) till vatten och syre. Skyddar celler mot ROS.

Kemoautotrof

Använder energi från kemiska reaktioner och koldioxid som kolkälla.

Kemoheterotrof

Använder kemiska ämnen som energikälla och organiska ämnen som kolkälla.

Kemosyntes

Bildning av organiskt material med energi från kemiska reaktioner.

Kemotaxis

Rörelse mot eller bort från ett kemiskt ämne.

Kemotrof

Får energi från kemiska reaktioner.

Kolfixering

Omvandling av oorganiskt kol, vanligen CO₂, till organiska molekyler.

Kommensalism

En gynnas, den andra påverkas inte.

Kompetent

Kan ta upp fritt DNA från omgivningen.

Konidiospor/konidium (pl. konidia)

Asexuell svampsporer.

Konjugering

Överföring av genetiskt material (plasmid) mellan celler genom direkt kontakt (sex-fili).

Kromofor

Den del av en molekyl som absorberar ljus vid vissa våglängder ex. klorofyll och bakterioklorofyll.

Kvävefixering

Omvandling av kvävgas (N₂) till ammoniak eller andra biologiskt användbara kväveföreningar.

Kärngenom (core genome)

Gener som delas av alla stammar inom en definierad grupp/art.

Lav

Symbios mellan en svamp och en fotosyntetiserande partner, vanligen en alg eller cyanobakterie.

Leghemoglobin

Syrebindande protein i rotknölar hos baljväxter som reglerar syretillgången för kvävefixerande bakterier.

Lignocellulosa

Komplex blandning av cellulosa, hemicellulosa och lignin i växters cellväggar.

Lipopolysackarid (LPS)

Molekyl i det yttre membranet hos många gramnegativa bakterier; kan utlösa starka immunreaktioner.

Litotrof

Energi genom oxidation av reducerade oorganiska ämnen.

Lyofiliserad

Frystorkad genom att vatten avlägsnas under lågt tryck.

Lysogeni

Tillstånd där en bakteriofags arvsmassa finns kvar i bakterien utan att omedelbart orsaka att den spricker.

Lysogenisk bakteriofag

Fag som inte dödar bakterien omedelbart utan istället integrerar sitt DNA i bakteriens DNA.

Lytisk bakteriofag

Fag som förökar sig i bakterien och vanligen får den att lysera (spricka).

Lytiskt virus

Virus som förökar sig och orsakar att värdcellen lyseras.

Metanogen

Organism, vanligen en arké, som producerar metan.

Metanogenes

Biologisk produktion av metan, oftast i syrefri/fattig miljö.

Metanotrof

Organism som kan använda metan som kol- och energikälla.