Biologie de la Cellule : Les Grands Domaines du Vivant

Flashcards de vocabulaire couvrant les grands domaines du vivant (Eubactéries, Archées, Eucaryotes), les caractéristiques structurales, moléculaires, membranaires et évolutives abordées dans le cours.

Métabolisme propre

Ensemble des réactions biochimiques assurées de manière autonome par la cellule pour assurer son fonctionnement, son renouvellement et sa reproduction.

Virus

Entité biologique utilisant la matière organique mais dépourvue de métabolisme et de capacité de reproduction propre, dont la multiplication dépend entièrement de la machinerie des cellules hôtes infectées.

Nucléoïde

Région irrégulière du cytoplasme procaryote, dépourvue de membrane délimitante, dans laquelle est compacté le chromosome bactérien circulaire unique.

Plasmide

Petite molécule circulaire d'ADN double brin extrachromosomique portant des gènes accessoires (ex. : résistances aux antibiotiques), capable de réplication autonome et de transfert horizontal.

Mésosome

Repli interne complexe de la membrane plasmique chez certaines bactéries aérobies servant de membrane respiratoire, analogue fonctionnel des crêtes mitochondriales.

Peptidoglycane

Polymère réticulé composé de chaînes glycaniques formant l'armature structurale de la paroi bactérienne et présentant une forte affinité pour l'eau.

Bactérie Gram-positive

Bactérie entourée d'une épaisse couche de peptidoglycane associée à des acides teichoïques et lipoteichoïques, recouvrant directement la membrane plasmique sans membrane externe.

Bactérie Gram-négative

Bactérie dont la paroi comprend une fine couche de peptidoglycane surmontée d'une membrane externe riche en porines et en lipopolysaccharides (LPS).

Lipopolysaccharide (LPS)

Endotoxine composant le feuillet externe des bactéries Gram négatives dont la libération massive lors d'une infection stimule excessivement le système immunitaire et peut causer une septicémie.

Capsule bactérienne

Enveloppe externe protectrice formée de polysaccharides complexes entourant la paroi de certaines bactéries (ex. : $Streptococcus$), facilitant leur fixation aux tissus de l'hôte.

Flagelle procaryote

Structure locomotrice rotative composée d'un corps basal moteur ancré utilisant un gradient de protons, d'un crochet flexible coudé et d'un filament tubulaire rigide formé de flagelline.

Pili (fimbriae)

Appendices filamenteux protéiques disposés à la surface des procaryotes, permettant l'adhérence aux surfaces solides, aux tissus hôtes ou à d'autres bactéries.

Conjugaison bactérienne

Transfert horizontal unidirectionnel d'ADN plasmidique (tel que le facteur $F$) d'une bactérie donneuse $F^+$ à une bactérie réceptrice $F^-$ par l'intermédiaire d'un pilus sexuel.

Biofilm bactérien

Communauté multicellulaire structurée fixée à une surface, se développant par adhérence initiale réversible de bactéries pionnières, consolidation irréversible, maturation au sein d'une matrice protectrice et dispersion.

$\alpha$-protéobactéries

Groupe majeur de bactéries Gram négatives comprenant les genres $Rhizobium$ et $Agrobacterium$, et dont dérive l'ancêtre endosymbiotique de la mitochondrie.

$\gamma$-protéobactéries

Groupe de bactéries Gram négatives incluant l'organisme modèle $Escherichia\;coli$ ainsi que la bactérie géante $Thiomargarita\;magnifica$, qui séquestre son ADN dans des compartiments membranaires.

Cyanobactéries

Eubactéries photosynthétiques oxygéniques, solitaires ou filamenteuses, à l'origine de dépôts calcaires appelés stromatolithes et ancêtres endosymbiotiques des chloroplastes des végétaux.

Bacillota

Phylum d'eubactéries majoritairement Gram positives regroupant des bactéries telluriques ou pathogènes telles que $Mycobacterium$, les lactobacilles, les staphylocoques et les streptocoques.

Liaison éther (lipides d'Archées)

Liaison covalente spécifique reliant le glycérol aux chaînes hydrocarbonées ramifiées des lipides d'Archées, plus résistante que la liaison ester présente chez les Eubactéries et les Eucaryotes.

Membrane en monocouche (tétraéthers)

Arrangement membranaire présent chez certaines archées hyperthermophiles, où les lipides forment une couche continue de molécules tétraéthers traversant l'épaisseur membranaire pour éviter la fluidification à haute température.

Groupe Asgard

Lignée d'archées découverte dans les sédiments marins profonds (sources hydrothermales froides, Islande) présentant des expansions tentaculaires et formant le groupe frère phylogénétique direct des Eucaryotes.

Scissiparité

Mode de reproduction asexuée par division cellulaire binaire simple, caractéristique des procaryotes (bactéries et archées).

Microtubule

Cylindre protéique creux de $25\,\text{nm}$ de diamètre externe, élément majeur du cytosquelette eucaryote constitué de protofilaments d'hétérodimères de tubuline.

Axonème

Appareil moteur axial des cils et flagelles eucaryotes constitué d'une couronne de $9$ doublets périphériques entourant $1$ paire centrale de microtubules, mis en mouvement par des bras moléculaires de dynéine et des ponts de nexine.

Cellule chimère (eucaryote)

Cellule composite issue d'événements de symbiogenèse successifs intégrant un génome nucléaire (d'origine archée type Lokiarchée), un génome mitochondrial (d'origine protéobactérienne) et éventuellement un génome plastidial (d'origine cyanobactérienne).

Unicontes

Clade d'organismes eucaryotes dont les cellules mobiles possèdent typiquement un flagelle propulseur unique dirigé vers l'arrière, incluant les Amoebozoaires, les Eumycètes, les Choanoflagellés et les Métazoaires.

Bicontes

Clade d'organismes eucaryotes caractérisés ancestralement par deux flagelles (généralement antérieurs et tracteurs), comprenant notamment la Lignée verte et le Clade SAR.

Clade SAR

Grand groupe d'eucaryotes bicontes regroupant les Straménopiles (dont les algues brunes), les Alvéolés (Ciliés, Dinophytes, Apicomplexés) et les Rhizariens.

Lignée verte

Groupe monophylétique d'eucaryotes bicontes photosynthétiques regroupant les Rhodobiontes (algues rouges), les Chlorophytes (algues vertes) et les Plantes terrestres.

Métazoaires

Organismes eucaryotes pluricellulaires hétérotrophes constituant les animaux, rattachés à la lignée des Unicontes au sein de l'arbre phylogénétique.