organik kimya.2

  1. TIBBI ORGANIK KIMYA-I-II

SUNUM PLANI

Biyomolekülleri Oluşturan Temel Elementler

  • Biyomoleküllerin oluşturan temel elementler: H, C, N, O

  • Biyo-elemanların % 97'sini oluştururlar.

Molekül İçi Kimyasal Bağlar

  • Kovalent Bağlar

    • Apolar, polar ve koordine kovalent bağlar.

  • İyonik Bağ

Moleküller Arası Kuvvetler ve Biyomoleküllerdeki Önemi

  • Hidrojen bağı

  • Dipol-dipol etkileşim

  • Hidrofobik etkileşim

  • Hidrofilik etkileşim

  • İyonik etkileşim

  • Van der Waals bağları

Molekül Geometrisinin Biyomoleküllerdeki Önemi

İzomerizm ve Sınıflandırılması

Organik Kimyanın Biyokimyadaki Önemi

Hidrokarbonların Sınıflandırılması ve Biyomoleküllerdeki Yeri

Biyokimya

  • Yaşamın temel kimyasıyla ilgilenen bilim dalıdır.

  • Canlı sistemlerin yapısal ve fonksiyonel birimi olan hücrenin kimyasal yapı taşlarını ve bunların katıldığı reaksiyonları inceler.

  • Hücresel reaksiyonların çoğu organik reaksiyonlar yoluyla gerçekleşir.

  • Biyokimyayı anlamak için organik kimya perspektifinden bakmak gereklidir.

Atomun Yapısı

  • Atom, elektron, proton ve nötrondan oluşur.

  • Nötron ve proton çekirdekte bulunur.

  • Elektronlar ışık hızına yakın bir hızda çekirdek etrafında hareket ederler.

  • Atomun proton sayısını belirten sayıya atom numarası denir.

Proton ve Nötronların Özellikleri

  • Proton ve nötronlar eşit kütleye sahiptirler.

  • Elektronların kütlesi, protonların 1/2000’i kadardır.

Canlılık

  • Hücrelerde oluşan kimyasal reaksiyonların devamlılığıdır.

Moleküler Yapılar

  • Atom -> Molekül -> Makromolekül -> Hücre

Biyomolekülleri Oluşturan Temel Elementler

  • H, C, N, O: % 97

  • Geri kalan makro ve mikro elementler

Molekül İçi ve Moleküller Arası Kimyasal Bağlar

Kovalent Bağlar

  • Atomlar arasında bağ yaparak elektronların ortaklaşa kullanılmasıyla oluşan bağlardır.

  • İyonik bağ ve nötronlar arasındaki kuvvetler önemlidir.

İyon Kavramı

  • Elektron alış-verişi yapmış atomlara iyon denir.

  • Katyonlar (pozitif) ve anyonlar (negatif) şeklinde ikiye ayrılır.

Moleküller Arası Kuvvetler

  • Hidrojen Bağı

    • Moleküller arasında güçlü bağlar.

  • Van der Waals

    • Zayıf çekim kuvvetleri.

Fonksiyonel Gruplar

Tanımı

  • Kimyasal tepkimelerden sorumlu belli atom gruplarıdır.

Kimyasal Tepkimelere Yatkınlık

  • Doymuş hidrokarbonlar zorlu reaksiyonlar gösterirken, fonksiyonel grupları bulunan biyomoleküller daha etkilidir.

Fonksiyonel Gruplar ve Kimyasal Tepkimelere Yatkınlık

  • Örnekler: Karboksilli asitler, esterler, amidler, amintürler, vb.

  • Biokimyasal tepkimelerin çoğu bu gruplar arasındaki etkileşimlerle ilgilidir.

Karboksilli Asitler

  • Yapısında karboksil grubu (-COOH) bulunduran organik moleküllerdir.

  • Mono ve poli karboksilli asitler olarak ikiye ayrılır.

Amino Asitler

  • Yapısında amino grubu (-NH2) ve karboksil grubu (-COOH) bulunan temel yapı taşlarıdır.

  • 20 temel amino asit vardır ve bazıları esansiyel kabul edilir.

Lipid ve Ester Bağları

  • Yağ asitleri ve gliserol, ester bağlarıyla birleşerek lipid oluşturur.

Dış Bağlantılar

  • Su ve amonyak molekülleri arasındaki hidrojen bağları, biyomoleküllerin yapıtaşlarını belirler.

Notlar

  • Moleküllerin şekli, fiziksel ve kimyasal özelliklerini belirler.

  • Biyolojik aktivitelerin çoğu bu bağlar üzerinden gerçekleşir ve bu nedenle bağların enerjisi önemlidir.