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핵막 및 구조 관련

  • lamin: 핵막 안쪽을 지지하는 섬유성 단백질로, 핵 구조 안정화에 중요한 역할

  • lamina: lamin으로 이루어진 망사 구조로, 핵막 바로 아래에 위치

  • LBR (Lamin B Receptor): 내핵막 단백질로, lamin과 상호작용

  • Emerin: 내핵막 단백질이며, lamin과 염색질 결합에 관여

  • LINC Complex: 핵과 세포골격을 연결하는 단백질 복합체

    • KASH: LINC complex의 외측 구성 요소로, 세포질에 위치
    • SUN: LINC complex의 내측 구성 요소로, 핵막 안쪽에 존재

핵공복합체 및 단백질 이동

  • FG Nups: 핵공복합체(NPC) 내부의 수송 필터 역할을 하는 단백질
  • NLS (Nuclear Localization Signal): 단백질을 핵 안으로 들여보내는 신호 서열
  • importins: NLS를 가진 단백질을 핵 안으로 수송하는 단백질
  • Ran: 핵수송에 필요한 GTPase로 방향성을 제공
  • NTF2: 핵으로 Ran-GDP를 들여보내는 단백질
  • Ran GEF: Ran에 GTP를 결합시켜 활성화하는 핵 내 단백질
  • Ran GAP: Ran-GTP를 GDP로 변환시켜 비활성화시키는 세포질 단백질
  • NES (Nuclear Export Signal): 핵 밖으로 단백질을 내보내는 신호 서열
  • Exportin: NES를 가진 단백질을 핵 밖으로 수송하는 단백질
  • Karyopherin: 핵수송을 담당하는 단백질 군으로 importin/exportin을 포함
  • Crm1: 주요 exportin, NES 인식을 통해 수송 수행

전사 조절 / 헬리케이스 / 운반

  • Helicase: DNA 또는 RNA 이중가닥을 푸는 효소
  • Snurportin: snRNP를 핵 안으로 수송하는 단백질
  • NF-kB: 염증 반응 관련 전사인자
  • IkB: NF-kB 억제 단백질, 분해되면 NF-kB가 핵으로 이동

핵 내 도메인 및 공간 조직

  • TAD (Topologically Associating Domain): 유전자 조절에 중요한 3차원 염색질 구조 단위
  • LADs (Lamina-Associated Domains): 핵막 라미나에 붙는 염색질 영역, 유전자 발현이 낮음
  • NADs (Nucleolus-Associated Domains): 핵소체(Nucleolus) 근처의 염색질 영역
  • LLPS (Liquid-Liquid Phase Separation): 액체-액체 분리 현상, 세포소기관 무막 형성 기전
  • nucleolus: 리보솜 RNA 합성 장소
  • nucleoli: nucleolus의 복수형
  • polycomb body: 유전자 억제 관련 단백질들이 모여 있는 핵 내 소기관
  • cajal body: RNA 가공, snRNP 조립이 일어나는 핵 내 구조
  • speckles: RNA 스플라이싱 관련 단백질들이 분포하는 핵 내 구조

단백질 합성과 ER 관련

  • SRP (Signal Recognition Particle): 막단백질 합성 시 리보솜을 ER로 유도
  • signal peptidase: ER 안에서 signal peptide를 자르는 효소
  • translocon: 리보솜-ER 사이 단백질 통로, Sec61 complex 포함
  • TRC40: tail-anchored 단백질을 ER로 운반하는 단백질
  • GET1-GET2: TRC40가 전달하는 단백질을 막에 삽입하는 ER 수용체
  • BiP: ER chaperone 역할을 하며 단백질 접힘을 돕고 ER stress 대응
  • PDi (Protein Disulfide Isomerase): ER에서 이황화 결합 형성 및 재배열
  • Dolichol: N-glycosylation 시 당이 붙는 지질 운반체
  • GPI anchors: 단백질을 세포막에 고정시키는 글리콜리피드 구조

ER stress 및 품질관리

  • ERAD (ER-associated degradation): 잘못 접힌 단백질을 분해하는 경로
  • IRE1: UPR (Unfolded Protein Response) 센서로 XBP1 스플라이싱 유도
  • XBP1: ER 스트레스 시 활성화되는 전사 인자
  • ATF6: ER 스트레스 센서로 핵으로 이동해 유전자 조절
  • PERK: eIF2α 인산화로 번역 억제, UPR 경로 구성 요소
  • eIF2 (eukaryotic Initiation Factor 2): 단백질 번역 개시 복합체, 스트레스 시 조절됨

소포체 및 수송

  • ERES (ER Exit Sites): ER에서 vesicle이 budding하는 장소
  • ERGIC (ER-Golgi Intermediate Compartment): ER과 골지체 사이 중간 구조체
  • KDEL: ER로 단백질을 되돌리는 신호 서열
  • Glycolipid: 당이 붙은 지질, 세포막 구성요소
  • Sphingomyelin: 스핑고지질의 일종으로 세포막에서 중요
  • apical domain: 극성세포에서 위쪽 표면으로 분비 및 흡수 역할
  • basolateral domain: 극성세포에서 아래/옆면으로 다른 조직과 연결

수송 소포 관련 단백질

  • COPII-coated vesicles: ER → 골지체 수송에 관여, Sec23/24, Sec13/31 포함
  • COPI-coated vesicles: 골지체 → ER 역수송 또는 골지 내 이동
  • Clathrin-coated vesicles: 세포막 → endosome 또는 골지체 → endosome 수송에 관여
  • ATF1: 전사인자로 스트레스 반응에 관여 가능
  • Sar1: COPII vesicle 형성을 시작하는 GTPase
  • Rab: 소포의 위치 결정 및 융합 조절 GTPase
  • SNARE: 소포와 타겟막의 융합을 유도하는 단백질군