Lys er elektromagnetisk stråling synlig for det menneskelige øyet.
Lys består av fotoner.
Et fotons energi er proporsjonal med frekvensen: E = hf (der E er energi, h er Plancks konstant, og f er frekvens).
Forstørrelse: Mikroskopets evne til å forstørre et objekt.
Oppløsning: Evnen til å skille to nærliggende punkter.
Oppløsning bestemmes av formelen: d = \frac{0.61\lambda}{nsin\theta}, hvor:
d = oppløsning
\lambda = bølgelengde av strålingen
n = brytningsindeks av mediet
\theta = halvparten av vinkelen av lyskjeglen som kommer inn i objektivet
Oppløsningen avhenger av bølgelengden til strålingen og linsens evne til å samle lys.
Lysmikroskop:
Bruker lysstråler og optiske linser.
Enkle å håndtere og tar liten plass.
Elektronmikroskop:
Bruker elektronstråler og elektromagnetiske linser.
Krever mer opplæring og tar mer plass.
Atom: 0.1 nm
DNA: 2 nm
Protein: 1 nm
Virus: 10 nm
Bakterie: 1 μm eller 4μm
Mitochondria:
Gjær: 10 μm
Human egg:
Plant cell:
Frog egg:
Human red blood cell: 8 μm
Måleenheter:
1 nm (nanometer) = 10^{-9} m
1 μm (mikrometer) = 10^{-6} m
1 mm (millimeter) = 10^{-3} m
Lysfelt, mørkefelt, fasekontrast.
Synlig lys, oppløsning ned til ca. 0.2 - 0.3 μm.
1000 ganger høyere oppløsning enn det blotte øye.
Visualisering basert på forskjeller i kontrast mellom prøven og omgivelsene.
Lys fra lyskilden fokuseres på objektet via kondensorlinsen.
Lysstrålene passerer videre til objektivlinsen (10-100x forstørrelse).
Lyset passerer til slutt gjennom okularlinsen (10-30x forstørrelse).
Okular (Ocular)
Objektiv (Objective)
Objektbord (Stage)
Kondensator (Condenser)
Fokuseringsknotter (Focusing knobs)
Lyskilde (Light source)
Farging øker kontrasten.
Fargen binder seg til ulike cellematerialer
Basiske farger (positivt ladet) binder seg til nukleinsyrer og negative polysakkarider (f.eks. metylenblått, krystallfiolett, safranin).
Generell farging: Alle celler farges.
Differensiell farging: Skille mellom ulike typer mikroorganismer (brukes ofte ved klassifisering og identifisering).
Farging av spesielle cellekomponenter (f.eks. endosporer, flageller, kapsel, fett).
Spre kultur i en tynn film over objektglasset.
Lufttørk.
Pass objektglasset gjennom en flamme for å varmefiksere.
Tilsett farge, skyll og tørk.
Plasser en dråpe olje på objektglasset og undersøk med 100x objektivlinse.
Klassifisering av bakterier basert på forskjeller i celleveggstrukturen.
Skiller mellom to hovedgrupper av bakterier:
Gram-positive
Gram-negative
Påføring av krystallfiolett (farger alle celler lilla).
Påføring av jod (mordant; fikserer fargen).
Alkoholvask (dekolorisering; gram-negative mister farge).
Påføring av safranin (motfarge; farger gram-negative rosa).
Gram-positive bakterier beholder krystallfiolett-fargen og ser lilla ut.
Gram-negative bakterier mister krystallfiolett-fargen og farges rosa av safranin.
Hensikt: Øke kontrast.
Fordeler: Unngå farging.
Objektiv
Prøve
Kondensorlinse
Lys kilde
Sentral apertur
Basert på at cellekomponenter fluorescerer (sender ut lys) etter bestråling med kortbølget lys eller UV-stråler, enten direkte eller etter farging med spesielle fargestoffer.
Absorpsjon av lys ved en bølgelengde (eksitasjon) og utsendelse av lys ved en lengre bølgelengde (emisjon).
Illustration of absorbance and fluorescence spectra.
Konfokalmikroskopi
Differensiell interferenskontrast (DIC)
Bruker elektronstråler istedenfor lysstråler.
Elektromagneter brukes til å fokusere elektronstrålen istedenfor glasslinser.
Kortere bølgelengde gir bedre oppløsning enn lysmikroskop.
Typer:
Transmisjonselektronmikroskop (TEM): Tynne skiver som farges.
Scanning- eller sveipelektronmikroskop (SEM): Prøven dekkes med et tynt lag gull; en elektronstråle skanner over overflaten.
Eksempler på bilder tatt med elektronmikroskop.
Lysmikroskopi: Bilde vises direkte.
Transmisjonselektronmikroskopi: Elektroner, 2D bilde vises på fluorescerende skjerm
Scanningelektronmikroskopi: Elektroner, 3D bilde vises på skjerm
Lysmikroskopi
Elektronmikroskopi
Lysmikroskopi:
Lysfelt
Fasekontrast
Mørkefelt
Fluorescens
Differensiell interferenskontrast
Konfokal
Elektronmikroskop:
TEM (Transmisjons Elektron Mikroskop)
SEM (Scanning Elektron Mikroskop)
MATV1007 Mikrobiologi og bioteknologi (2025 VÅR)
Cellebiologi - Uke 3 - Prokaryote celler
Mandag 13. januar 2025
Domener: Bacteria, Archaea, Eukaryotes
Eukaryoter inkluderer Protists, Plants, Fungi, Animals.
Prokaryot celle vs Eukaryot celle
Prokaryote cellekomponenter:
Flageller
Plasmid
Kjerneregion (nukleoid)
Cellevegg
Kapsel
Pili
Ribosomer
Cellemembran
Cytoplasma
Eukaryote cellekomponenter:
Endoplasmatisk retikulum (ER)
Kornet ER
Glatt ER
Peroksiom
Lysosom
Mikrofilamenter
Mikrotubuli
Mitokondrium
Vakuole
Golgiapparat
Intermediære filamenter
Nukleolus
Nukleoplasma
Kromatin (DNA)
Kjernemembran
Kjerne (nukleus)
Kokker: Runde celler.
Staver: Lange celler.
Spiriller: Spiralformede celler.
Spiroketer: Spiralformede celler (forskjellig fra spiriller).
Celler med knopper og stilk.
Filamenter: Trådformede celler.
Kokker:
Diplokokker: To og to.
Streptokokker: Kjeder.
Stafylokokker: Hoper.
Staver:
To og to staver.
Kjeder av staver.
Parallelle staver.
Streptococcus
Neisseria
Sarcina
Stafylokokker
Bakterier er sjelden over 10 μm, ofte rundt 1 μm.
Eksempler:
BACILLUS
ESCHERICHIA
SERRATIA
STAPHYLOCOCCUS
STREPTOCOCCUS
Diskuter med sidemannen: Størrelse og overflateareal vs. volum.