biochemia 22
BIOCHÉMIA PROTEOSYNTÉZY
35. POZNÁMKY K BIOCHÉMII PROTEOSYNTÉZY
35.1 Úvodné poznámky
Proteosyntéza (translácia):
Predstavuje vyvrcholenie prenosu genetickej informácie uloženej v nukleotidových bázach DNK do bielkovinových molekúl.
Bielkovinové molekuly sú hlavným štrukturálnym a funkčným zložením živých buniek.
Počas translácie prebieha využitie informácie zakódovanej v špecifickej nukleotidovej sekvencii mRNK (messenger RNA) na syntézu bielkoviny, vrátane jej trojrozmernej štruktúry a poradia aminokyselín.
Interakcia medzi RNK a proteínovou mašinériou:
Hlavné prvky:
Ribozómy: Miesto syntézy proteínov
mRNK (messenger RNA): Kontroluje syntézu bielkoviny
tRNK (transfer RNA): Transportuje aminokyseliny na ribozómy.
Syntéza bielkoviny:
Riadi ju mRNK, pretože obsahuje informáciu o poradí aminokyselín.
tRNK prekonáva zodpovedajúcim spôsobom, kde sa na ribozóme mRNK a tRNK spoja na zabezpečenie správneho poradia aminokyselín.
Hlavné fázy procesu translácie:
Iniciácia
Elongácia
Terminácia
Mechanizmy alokácie špecifických proteínov
Posttranslačné modifikácie bielkovín.
35.2 Poznámky k biochemickým princípom
Genetická informácia: Prepísaná z DNK na mRNK sa skladá zo štyroch bázy a má byť prenesená na 20 aminokyselín, ktoré tvoria bielkoviny.
Kodóny: Tri nukleotidy RNK tvoria kodón pre špecifickú aminokyselinu. Existuje 64 kombinácií, z ktorých tri slúžia ako signály.
Genetický kód: Univerzálny pre všetky organizmy, číta sa systémom jednoznačnosti bez „diakritiky“ od začiatku po koniec.
35.3 Poznámky ku proteosyntetickej mašinérii
Ribozóm: Skladá sa z dvoch podjednotiek a obsahuje miesto na väzbu tRNA.
Syntéza aminokyselín: Ku každej aminokyseline patrí špecifická syntetáza, ktorá ju pripojuje na tRNK. Ribozóm obsahuje proteín kódujúcu oblasť pre mRNK.
Flexibilita: Pri párovaní báz zohráva mRNK flexibilitu, informácia o syntéze nie je na začiatku mRNK.
Dynamický proces translácie: Závisí na interakciách enzýmov, tRNK, ribozómov a mRNK. Môže sa rozdeliť na tri kroky: iniciácia, elongácia a terminácia.
Iniciácia: Začína spojením dvoch podjednotiek ribozómu a nadviazaním na mRNK, vznik komplexu sa uskutočňuje pôsobením iniciačných faktorov.
Elongácia: Začína väzbou tRNA, pričom vyžaduje splnenie komplementarity kodónu a antikodónu. V procese sa zapájajú faktory, ktoré sú cieľom niektorých antibiotík.
Terminácia: Začína prečítaním „stop“ kodónu; posledná tRNK sa uvoľňuje a ribozóm sa disociuje. Posledný sa uvoľní novosyntetizovaný proteín.
35.4 Cieľovanie bielkovín
mRNK sa môže viazať na viac ribozómov a vytvára polyzómy. Existujú voľne cirkulujúce a viazané na endoplazmatické retikulum.
Bunkový osud novosyntetizovaných bielkovín závisí od signálnych peptidov a väčšina z nich podlieha úpravám v endoplazmatickom retikule alebo Golgiho aparáte.
Posttranslačné modifikácie: Skracovanie reťazca aminokyselín, môžu tiež podliehať jednotlivé aminokyseliny.
35.5 Klinický kontext
Choroby vznikajúce citlivosťou na zámenu páru báz. Tetracyklín inhibuje proteosyntézu baktérií na úrovni čítania mRNK.
Enzýmy vo proteosyntéze: Aminoacyl-tRNK syntetáza zabezpečuje bezpečnosť proteosyntézy, peptidyltransferáza je súčasťou ribozómov.
Model syntézy bielkovín vysvetľuje rôzne javy.
35.6 Najdôležitejšie vzorce a schémy
Genetický kód: Zobrazenie vzorov kódu pre aminokyseliny.
Transkripcia a translácia: Procesy, ktorými sa prenáša informácia.
BIOCHÉMIA IMUNITY
36. POZNÁMKY K BIOCHÉMII IMUNITY
36.1 Úvodné poznámky
Imunitný systém: Skladá sa z tkanív, buniek a molekúl, ktoré rozpoznávajú, reagujú a eliminujú cudzie látky (antigény).
Imunitná odpoveď: Zahrňuje niešpecifickú (vrodenú) a špecifickú (získanú) zložku.
36.2 Nešpecifická vs. špecifická imunitná odpoveď
Nešpecifická odpoveď: Prvá línia obrany, vrátane fyzikálnochemických bariér (napr. koža) a mediátorov zápalu ako leukotriény a cytokiny.
Zápal: Odpoveď na poranenie, cieľom je obnoviť kontinuitu tkaniva. Mediátory zápalu považované za humorálnu zložku.
Špecifická odpoveď: Dosiahne sa rozpoznaním antigénu špecializovanými receptormi. Doba adaptácie závisí od prežitia organizmu.
36.3 Lymfocyty a ich úlohy
Lymfocyty: Rozdelia sa na T (celulárna immunita) a B (humorálna imunita). Primárne lymfatické tkanivá: embryonálna pečeň, kostná dreň, týmus; sekundárne: lymfatické uzliny, slezina.
Regulácia cirkulácie lymfocytov: Závisí na exprimentačných markeroch.
Pri poškodení tkaniva naplnenie lymfocytmi a blastická transformácia v uzlinách vedie k špecifickej odpovedi.
Vytváranie pamäťových buniek.
36.4 Antigénové receptory
Rozlíšenie medzi T a B lymfocytmi na základe ich receptorov (typické markery: CD 3, CD 4, CD 8 pre T, CD 19, CD 20 pre B).
Interakcia antigénových receptorov: K interakcii medzi antigénom a receptorom dochádza ako pri navliekaní ruky do rukavice.
36.5 Odpoveď na antigén
Pri kontakte sa bunky delia a diferencujú na efektorové a pamäťové bunky, cieľom je klonovať bunky pre presnú odpoveď.
Klonálna selekcia: Proces hrajúci kľúčovú úlohu v pamäti imunitného systému.
36.6 Humorálne mediovaná odpoveď
Humorálna imunitná odpoveď: Zameraná na extracelulárnu infekciu a produkciu protilátok. Protilátky (imunoglobulíny) majú rôzne podtriedy (IgG, IgA, IgM, IgD, IgE).
Reakcia na antigén: Odpoveď je vyvolaná aktiváciou T a B buniek, produkujú protilátky a vyžadujú iniciovanú imunitnú odpoveď.
36.7 Hlavný histokompatibilný systém
HLA systém: povaha rozpoznávania antigénu, závisí od génov na chromozóme šest.
Týmusová výchova: Prevence autoimunity pomocou klonálnej delécie.
ImunODEFIS: Dysfunkcia môže viesť k autoimúnnym ochoreniam.