biochemia 22

BIOCHÉMIA PROTEOSYNTÉZY

35. POZNÁMKY K BIOCHÉMII PROTEOSYNTÉZY

35.1 Úvodné poznámky

  • Proteosyntéza (translácia):

    • Predstavuje vyvrcholenie prenosu genetickej informácie uloženej v nukleotidových bázach DNK do bielkovinových molekúl.

    • Bielkovinové molekuly sú hlavným štrukturálnym a funkčným zložením živých buniek.

    • Počas translácie prebieha využitie informácie zakódovanej v špecifickej nukleotidovej sekvencii mRNK (messenger RNA) na syntézu bielkoviny, vrátane jej trojrozmernej štruktúry a poradia aminokyselín.

  • Interakcia medzi RNK a proteínovou mašinériou:

    • Hlavné prvky:

    • Ribozómy: Miesto syntézy proteínov

    • mRNK (messenger RNA): Kontroluje syntézu bielkoviny

    • tRNK (transfer RNA): Transportuje aminokyseliny na ribozómy.

  • Syntéza bielkoviny:

    • Riadi ju mRNK, pretože obsahuje informáciu o poradí aminokyselín.

    • tRNK prekonáva zodpovedajúcim spôsobom, kde sa na ribozóme mRNK a tRNK spoja na zabezpečenie správneho poradia aminokyselín.

  • Hlavné fázy procesu translácie:

    • Iniciácia

    • Elongácia

    • Terminácia

    • Mechanizmy alokácie špecifických proteínov

    • Posttranslačné modifikácie bielkovín.

35.2 Poznámky k biochemickým princípom

  • Genetická informácia: Prepísaná z DNK na mRNK sa skladá zo štyroch bázy a má byť prenesená na 20 aminokyselín, ktoré tvoria bielkoviny.

  • Kodóny: Tri nukleotidy RNK tvoria kodón pre špecifickú aminokyselinu. Existuje 64 kombinácií, z ktorých tri slúžia ako signály.

  • Genetický kód: Univerzálny pre všetky organizmy, číta sa systémom jednoznačnosti bez „diakritiky“ od začiatku po koniec.

35.3 Poznámky ku proteosyntetickej mašinérii

  • Ribozóm: Skladá sa z dvoch podjednotiek a obsahuje miesto na väzbu tRNA.

  • Syntéza aminokyselín: Ku každej aminokyseline patrí špecifická syntetáza, ktorá ju pripojuje na tRNK. Ribozóm obsahuje proteín kódujúcu oblasť pre mRNK.

  • Flexibilita: Pri párovaní báz zohráva mRNK flexibilitu, informácia o syntéze nie je na začiatku mRNK.

  • Dynamický proces translácie: Závisí na interakciách enzýmov, tRNK, ribozómov a mRNK. Môže sa rozdeliť na tri kroky: iniciácia, elongácia a terminácia.

    • Iniciácia: Začína spojením dvoch podjednotiek ribozómu a nadviazaním na mRNK, vznik komplexu sa uskutočňuje pôsobením iniciačných faktorov.

    • Elongácia: Začína väzbou tRNA, pričom vyžaduje splnenie komplementarity kodónu a antikodónu. V procese sa zapájajú faktory, ktoré sú cieľom niektorých antibiotík.

    • Terminácia: Začína prečítaním „stop“ kodónu; posledná tRNK sa uvoľňuje a ribozóm sa disociuje. Posledný sa uvoľní novosyntetizovaný proteín.

35.4 Cieľovanie bielkovín

  • mRNK sa môže viazať na viac ribozómov a vytvára polyzómy. Existujú voľne cirkulujúce a viazané na endoplazmatické retikulum.

  • Bunkový osud novosyntetizovaných bielkovín závisí od signálnych peptidov a väčšina z nich podlieha úpravám v endoplazmatickom retikule alebo Golgiho aparáte.

  • Posttranslačné modifikácie: Skracovanie reťazca aminokyselín, môžu tiež podliehať jednotlivé aminokyseliny.

35.5 Klinický kontext

  • Choroby vznikajúce citlivosťou na zámenu páru báz. Tetracyklín inhibuje proteosyntézu baktérií na úrovni čítania mRNK.

  • Enzýmy vo proteosyntéze: Aminoacyl-tRNK syntetáza zabezpečuje bezpečnosť proteosyntézy, peptidyltransferáza je súčasťou ribozómov.

  • Model syntézy bielkovín vysvetľuje rôzne javy.

35.6 Najdôležitejšie vzorce a schémy

  • Genetický kód: Zobrazenie vzorov kódu pre aminokyseliny.

  • Transkripcia a translácia: Procesy, ktorými sa prenáša informácia.


BIOCHÉMIA IMUNITY

36. POZNÁMKY K BIOCHÉMII IMUNITY

36.1 Úvodné poznámky

  • Imunitný systém: Skladá sa z tkanív, buniek a molekúl, ktoré rozpoznávajú, reagujú a eliminujú cudzie látky (antigény).

  • Imunitná odpoveď: Zahrňuje niešpecifickú (vrodenú) a špecifickú (získanú) zložku.

36.2 Nešpecifická vs. špecifická imunitná odpoveď

  • Nešpecifická odpoveď: Prvá línia obrany, vrátane fyzikálnochemických bariér (napr. koža) a mediátorov zápalu ako leukotriény a cytokiny.

  • Zápal: Odpoveď na poranenie, cieľom je obnoviť kontinuitu tkaniva. Mediátory zápalu považované za humorálnu zložku.

  • Špecifická odpoveď: Dosiahne sa rozpoznaním antigénu špecializovanými receptormi. Doba adaptácie závisí od prežitia organizmu.

36.3 Lymfocyty a ich úlohy

  • Lymfocyty: Rozdelia sa na T (celulárna immunita) a B (humorálna imunita). Primárne lymfatické tkanivá: embryonálna pečeň, kostná dreň, týmus; sekundárne: lymfatické uzliny, slezina.

  • Regulácia cirkulácie lymfocytov: Závisí na exprimentačných markeroch.

    • Pri poškodení tkaniva naplnenie lymfocytmi a blastická transformácia v uzlinách vedie k špecifickej odpovedi.

    • Vytváranie pamäťových buniek.

36.4 Antigénové receptory

  • Rozlíšenie medzi T a B lymfocytmi na základe ich receptorov (typické markery: CD 3, CD 4, CD 8 pre T, CD 19, CD 20 pre B).

  • Interakcia antigénových receptorov: K interakcii medzi antigénom a receptorom dochádza ako pri navliekaní ruky do rukavice.

36.5 Odpoveď na antigén

  • Pri kontakte sa bunky delia a diferencujú na efektorové a pamäťové bunky, cieľom je klonovať bunky pre presnú odpoveď.

  • Klonálna selekcia: Proces hrajúci kľúčovú úlohu v pamäti imunitného systému.

36.6 Humorálne mediovaná odpoveď

  • Humorálna imunitná odpoveď: Zameraná na extracelulárnu infekciu a produkciu protilátok. Protilátky (imunoglobulíny) majú rôzne podtriedy (IgG, IgA, IgM, IgD, IgE).

  • Reakcia na antigén: Odpoveď je vyvolaná aktiváciou T a B buniek, produkujú protilátky a vyžadujú iniciovanú imunitnú odpoveď.

36.7 Hlavný histokompatibilný systém

  • HLA systém: povaha rozpoznávania antigénu, závisí od génov na chromozóme šest.

  • Týmusová výchova: Prevence autoimunity pomocou klonálnej delécie.

  • ImunODEFIS: Dysfunkcia môže viesť k autoimúnnym ochoreniam.