ispiti biokem

  1. enzimi koji u CLK reduciraju koenzime pripadaju skupini enzima koje se nazivaju:

    dehidrogenaze

  2. ime enzima koji se u glukoneogenezi koristi kao alternativa heksokinazi

    glukoza-6-fosfataza

  3. sto je tocno o glukoneogenezi

    • misici imaju velike zalihe glikogena koji moze povisiti koncentracije glukoze u krvi u slucaju gladovanja

    • u gladovanju raste koncentracija masnih kiselina u cirkulaciji koje se koriste za sintezu glukoze

    • enzim glukoza 6 fosfataza hidrolizira glukozu 6 fosfat i enzim je prisutan u vecini stanica i organa

    • jetra glukoneogenzom odrzava normalne koncentracije glukoze u krvi tijekom gladovanja

  4. navedi puno ime glikolitickog intermedijera iz ojeg se izomerizacijom dobiva 2,3 DPG, vazan regulator afiniteta hemoglobina prema kisiku

    1,3 difosfoglicerat

  5. u koji se metabolicki put ukljucuje laktat?

    glikolizu u jetri

  6. koje su dvije najvaznije uloge pentoza fosfatnog puta?

    opskrba sa NADPH koji se koristi u reduktivnim biosintezama te ribozom za anabolicke namjere

  7. navedi imena dva enzima koji su dio pentoza fosfatnog puta, kojima su aktivnosti izrazito povisene u neoplasticnim stanicama

    transketolaza

    transaldolaza

  8. spoji sve odgovarajuce izvore energije za razlicite organe

    • jetra: glukoza, glikogen iz misica i jetre

    • eritrociti: glukoza

    • misici: ketonska tijela, glukoza, glikogen iz misica i jetre

    • mozak: ketronska tijela, glukoza, glikogen iz jetre

  9. kod vecine kopnenih kraljezaka NH4+ ion se pretvara u spoj koji se zove UREA u organu JETRI, a zatim izlucuje. Medutim, neke su zivotinje amonotelne, i izlucuju AMONIJAK kao konacan produkt metabolizma aminokiselina

  10. sinteza ATP je moguca iz

    • GTP

    • kreatin fosfata

    • reduciranih koenzima u aerobnim uvjetima

  11. transport acil-CoA u mitohondrij, u svrhu oksidacije masnih kiselina, ukljucuje formiranje intermedijera

    • acil-karnitina

  12. koja od sljedecih tvrdnji najboljje opisuje NAD+?

    • NAD+ se reducira u glikolizi, okisidaciji piruvata i CLK

    • u odsutnosti NAD+ CLK staje

  13. gdije se nalazi ATP sintaza

    • electron transportni lanac

    • unutarnja membrana mitohondrija

    • matrix mitohondrija

  14. smede masno tkivo sadrzi protein termogenin, koji transportira protone. sto ce se dogoditi ukoliko masne stanice aktivnonkoriste ovaj protonski kanal?

    • ATP sintaza ce se smanjiti, a proizvodnja toplinske energije ce se povecati

  15. sto je tocno o citokromima?

    • u strukturi sadrze hem

    • fe se neprekidno oksidira i reducira ako su citokromi funkcijnalni

    • to su mobilni nosaci elektrona u electon transportnom lancu

  16. glutation reduktaza treba kao konezim

    • NADPH kao reducens za vracanje GSSG u GSH oblik

  17. transketolaza, enzim pentoza fosfatnog puta kao koenzim koristi

    • B1 tiamin

  18. u tumorskim stanicama koje se intenzivno djele potreba za kojom komponentnom pentoza fosfatnog puta dominira

    • riboza 5-P, bez NADPH

  19. jetra sintetizira ketonska tijela, ali ih ne moze koristiti za podmirivanje vlastitih energetskih potreba, zasto?

    • nema enzim CoA transferazu

  20. koliko molekula ATP-a mogu dobiti misici u anaerobnim uvjetima iz 2 molekule beta-hidroksibutirata (BHB)

    • 23

  21. koliko molekula ATP se dobije potpunim sagorijevanjem palmitinske kiseline

    • 129molekule ATP

  22. koji opis CLK je najtocniji

    • vecina molekula ATP-a u CLK dobivena je supstratnoj fosforilaciji

  23. navedi 4 tocne kombinacije o bioloski aktivnim produtima aminokiselina

    • tirozin - adrenalin

    • triptofan - serotonin

    • arginin - NO(nitrogen oxide)

    • glutamat - gama amino butirat (GABA)

  24. upisi pravilnim redosljedom regulacijisku kaskadu metabolizma glikogena

    1. vezanje hormona za receptore na stanicnoj membrani

    2. aktivacija adenilat ciklaze

    3. formiranje cAMP

    4. fosforilacija protein kinaze

    5. fosforilacija glikogen sintaze

    6. fosforilacija fosforilaze b

  25. sto je tocno o glikolizi

    • fruktoza 1:6-bisfosfat se cijepa u gliceraldehid-3-fosfat i dihidroksiacteon fosfat

  26. sto NIJE tocno o glukoneogenezi

    • glicerol nastao hidrolizom triglicerola se knvertira u glukozu u glukoneogenezi

    • masne kiseline nastaje hidrolizom triglicerola izvor su C atoma u glukoneogenezi

  27. u glikolizi, najveci dio potencijalne energije koju je sadrzavala molekula glukoze se

    • sadrzava u obliku 2 piruvata

  28. spoji 2 enzima sa pravilnim opisom

    1. heksokinaza - lokaliziran u jetri, lokaliziran i nehepatickim tkivima, koristi ATP u katalickoj reakciji, inhibiran prokuktom reakcije - glukoza 6-fosfatom

    2. glukokinaza - lokaliziran u jetri, koristi ATP u katalitickoj reakciji, ima visok Km za glukozu

  29. vitamin C je kofaktor enzima

    • vizil hidroksilaze

  30. koji od navedenih organa ne moze metabolizirati ketonska tijela?

    • stanice bez mitohondrija ili bez aktivnih ec

    • eitrociti

    • jetra

  31. sto je tocno_

    • MIchaelisova konstanta se prividno povecava nakon terapije

    • physostigmin je strukturni analog pravom supstratu

    • povecavanjem koncentracije acetilkolina u misicima smanjuje se ucinkovitost physostigmina

  32. dvije iskljucivo ketogene aminokiseline su LEUCINE i LYSINE

  33. visoka koncentracija beta-hidroksibutirata u serumu mlijecnih krava znaci da

    • u energetskom metabolizmu dominira razgradnja masnih kiselina

    • mozak koristi ketonska tijela za svoje energetske potrebe

    • da se krave ne hrane sukladno sa povecanjem energetskim potrebama u laktaciji

  34. koji je od sljedecih enzima inhibitor malonetom?

    • fumaza

  35. sto je tocno o peptidnoj vezi?

    • ima karakter parcijalne dvostruke veze

    • rigidna je i ne omogucava rotaciju na tom mjestu

    • cijepaju je enzimi peptidaze

  36. omjer kolicina RNA/DNA za albumin je razlicit kod razlicitih zivotinja

    • mis 4.45

    • stakor 3.05

    • krava 1. 29

    • koja od ovih 3 zivotinje ima najkrace poluvrijeme zivota albumina: MIS

  37. zaokruzi sve moguce nacine oksidacije NADH u organizmu

    • aerobno laktatom

    • aerobno oksidativnom fosforilacijom

  38. spoji svojstva hemoglobina sa odgovarajucim navodima

    • methemoglobin: 1 Fe u oksidacijskom stanju 3+, 2 histidin na 5. koord poziciji Fe, 3 voda na 6. koord poziciji

    • oksimioglobin: 1 Fe u oksidacijskom stanju 2+, 2 histidin na 5. koord poziciji Fe, 3 kisik vezan na 6. koord poziciji Fe

    • deoksihemoglobin: 1 Fe u oksidacijskom stanju 2+, 2 histidin na 5. koord poziciji Fe, 3 slobodna 6. koord pozicija

  39. heksokinaza i glukokinaza imaju neke slicnosti i razlicitosti. ukoliko je tvrdnja tocna za heksokinazu i/ili glukokinazu upisi HK ili GK kod odgovarajuceg navoda

    • nalazi se u jetri - HK i GK

    • nalazi se u hepatickim tkivima - HK

    • zahtiijeva ATP u reakciji - HK i GK

    • ima visoki Km za glukozu - GK

    • inhibirana je glukoza 6 fosfatom - HK

  40. navedi biokemijske osobine alfa-helixa

  • lanac polipeptida omotan oko longitudinalne osi

  • Rgrupe strse u prostor

  • mogicnost promjene duzine

  • povoljne AK: cistin, nepovoljne: glicin i prolin

  1. koliko actil- konezima A, reduciranog koenzima i ATP treba utositi za sintezu palmitinske kiseline (16C)?

    8 acetil-CoA, 7 malonila, 14 NADPH, 7 ATP

  2. membrana mitohondrija je nepropusna za acetil CoA. u slucajevima kada su energetski i biosintetski zahtijevi stanice zadovoljeni, on izlazi iz mitohondrija

    • pomocu transportera karnitina

  3. adrenalin, noradrenalin i glukagon:

    • NE stimuliraju lipazu pomocu cAMPa

    • NE inhibiraju lipazu pomocu cAMPa

    • NE stimuliraju protein-kinazu direktno

    • NE inhibiraju razgradnju depoa masti

  4. produkti metabolizma hemoglobina su

    • bilirubin

    • zeljezo

    • hem

  5. sto je tocno o metabolizmu AK

    • nastali N atomi se provode u ureu a C atomi se mogu iskoristiti u dobivanju energije

  6. sto je tocno o kompetitivnim inhibitorima enzima?

    • vezu se na aktivni centar enzima

    • natjecu se sa supstratom za vezanje na aktivni centar enzima

  7. izmedu hemoglobina i mioglobina postoje strukturne i fx razlike

    • 02 se na hemoglobin veze kooperativno, na mioglobin ne

    • afinitet hemoglobina prema O2 odreduju i organski fosfati, poput difosfoglicerata

  8. nakon gladovanja duzeg od 3 dana dolazi do promjena u metabolizmu koje ukljucuje

    • smnjeno iskoristavanje glukoze u mozgu a intenzivnije koristenje ketona

  9. za enzima glukokinazu (jetra), vrijednost Michaelisove konstante Km=10mM, dok je MIchaelisova konstanta za heksokinazu (svugdije) Km < 0.1mM. ovakve vrijednosti Km upucuju na sljedece tvrdnje

    • glukokinaza je aktivna samo pri visokim koncentracijama glukoze

  10. fosforilacija na nivou supstrata ovdija se u glikolizi u reakciji kataliziranoj

    • fosfoglicerat kinazom

  11. u CLK u dvije reakcije dolazi do oslobadanja CO2. koji enzimi kataliziraju te reakcije?

    • izocitrat dehidrogenaza

    • alfa-ketoglutarat dehidrogenaza

  12. spoji odgovarajuci metabolicki put sa njegovom glavnomulogom u metabolizmu

    • glikoliza - formacija NADH i FADH2

    • glukoneogeneza - odrzavanje normalne koncentracije glukoze u krvi

    • pentoza-fosfatni put - sinteza NADPH i riboza 5-fosfata

    • sinteza glikogena - skladiste energije

    • razgradnja masnih kiselina - stvaranje ATP i gradivnih elementa biomolekula

  13. objasni ulogu glutationa u eritrocitima

    • on ima ulogu antioksidansa te tako stiti same eritrocite od oksidacijskog stresa

  14. koje su prednosti fosforolotickog cijepanja glikogena u odnosu na hidroliticko cijepanje ako se uzme u obzir energetski aspekt?

    • energetski povoljniji - secer je vec fosforiliran

    • kod misicne stanice nema prijenosnika za glukoza-1-fosfata → ne moze se transportirati iz stanice

  15. u respiratornom lancu stvara se gradijent pH

    • izmedu matrixa mitohondrija i intermembranskog prostora

  16. sto je tocno o regulaciji altivnosti piruvat kinaze (PK)?

    • niska koncentracija glukoze rezultira povisenim glukagonom, koji fosforilira PK i time je deaktivira

  17. navedi sve kofaktore i koenzime koji sudjeluju u navednoj reakciji (CLK konverzija piruvata u acetil koenzim A)

    • NAD

    • FAD

    • LIP KIS

    • TIAMIN

    • KOENZIM A

  18. navedi naziv jednog od inhibitora aktivnosti navedenog enzima

    • ATP

    • NADH

    • AcCoA

  19. ukoliko se aplicira Soraphen A sto je tocno

    • sinteza masti je inhibirana

    • sinteza malonil-koenzima A je smanjena

  20. za sintezu masnih kiselina koristi se energija reduciranih koenzima, koji se generiraju u:

    • pentoza fosfatnom putu

  21. u vecini biokemijskih reakcija postoji osnovna razlika izmedu NADH i NADPH

    • NADPH ima fosforilnu skupinu u adenozinskom dijelu molekule, a NADH nema

    • NADH se oksidira u respiratornom lancu dajuci ATP, dok NADPH sluzi kao donor vodika i elektrona u reduktivnoj biosintezi

  22. sto je tocno o aktivnosti pentoza fosfatnog puta u stanicama masnog tkiva sa intenzivnom sintezom masnih tkiva?

    • kao donor reduktivne E u sintezi masti potreban je NADPH

    • dominira oksidativni organak puta

    • glukoza 6 fosfat dehidrogenaza je u tim stanicama aktivna

  23. svi moguci nacini oksidacije NADH u organizmu

    • anaerobno laktatom

    • aerobno oksidativnom fosforilacijom

  24. navedi primarni i dominantni izvor energije u gladovanju dugom 10 dana za:

    • mozak - ketoni

    • misici - MK (ketoni)

    • jetra - masne kiseline

  25. inzulin djeluje na veliki broj metabolickih puteva, aktivacijom ili inhibicijom

    • glikoliza - A

    • glikogeneza - A

    • sinteza proteina - A

    • proteolizu - I

    • ketogenezu - I

    • lipolizu - I

    • glukoneogenezu - I

    • glikogenolizu - I

  26. navedi puni naziv enzima aerobnog puta metabolizma piruvata i navedi sve kofaktore i koenzime koji sudjeluju u reakciji

    • tiamin pirpfosfat B1

    • konezim A

    • liponska kiselina

    • slavin adenin dinukleotid

    • nikotinamin adenin dinukleotid

  27. konverzija laktata u piruvat odvija se u

    • jetri, gdije se laktat koristi za glukoneogenezu

  28. zasto je jetra jedini organ koji moze otpustiti glukozu u krvotok, zato sto sadrzi:

    • glukoza-6-fosfatazu

  29. zasto je CLK iskljucivo aeroban kada kisik ne sudjeluje niti u jednoj reakciji ciklusa?

    • zbog regeneracije reduciranih koenzima i nastavak sljedeceg ciklusa

  30. sto je tocno o citokromima?

    • u svojoj strukturi sadrze hem

    • Fe se mora naizmjenicno oksidirati i reducirati

    • to su pokretni nosaci elektrona elektron-transportnog lanca

  31. FADH predaje elektrone direktno UBIKINONU, sto rezultira manjom kolicinom dobivenog ATP-a

  32. glavni sastojak koenzima FADH je vitamin

    • riboflavin (B2)

  33. sinteza ATP-a je moguca iz

    • GTP

    • kreatin-fosfata

    • reduciranih koenzima u aerobnim uvjetima

  34. sto je tocno?

    • energija reduciranih koenzima moze se iskoristiti samo ako je dosputan kisik

    • u anaerobnim uvjetima u glikolizi se dobiva 4 ATP i trosi 2 ATP

    • da bi se dobila ista kolicina energije iz glukoze, koja se dobije potpunom oksidacijom, u anaerobnim uvjetima je potrebno potrositi puno vise glukoze

  35. zasto je vjerovatno da je kisik konacni akceptor elektrona? (redukcijski potencijal kisika je +0.82V)

    • NEMA NAJVECI REDUKCIJSKI POTENCIJAL

  36. sto je tocno o proteinima?

    • to su polipeptidi po strukturi

    • mutacija na DNA moze prozrukovati sintezu nefunkcijonalnog proteina

  37. prostetska skupina

    • je neproteinska grupa u konjugiranim proteinima

    • proteini bez prostetske skupine nazivaju se apoproteinima

    • obicno ima odlucujucu ulogu u funkciji samog proteina

  38. sto je tocno o alfa heliksu?

    • vodikove veze unutar jendog lanca

  39. nabroji interakcije koje stabiliziraju tercijalnu strukturu proteina

    • vodikove veze

    • hidrofobne sile

    • elektrostatske sile

    • van der Waalsove sile

    • disulfidne veze

  40. ukoliko protein ne zauzme pravilnu trodimenzijonalnu konformaciju:

    • uklanja se djelovanjem proteaza

    • ukoliko je konformacija rezistentna, moze dovesti do razvoja bolesti

  41. jedina aminokiselina koja nema kiralni centar je:

    • glicin

  42. u strukturi kolagena:

    • svaka treca aminokiselina je glicin

    • cesto se javlja hidroksiprolin

    • cesto se javlja hidroksilizin

    • osim hidroksilacije, aminokiseline se modificiraju i glikozilacijom

  43. nabroji funkcije proteina u organizmu

    • kataliza (enzimi)

    • strukturni rpoteini (kolagen)

    • kretanje (leukociti)
      obrana (trombin, imunoglobulini)

    • regulacija procesa (hormoni)

    • transport (hemoglobin)

    • toksini

  44. dali je moguca renaturacija denaturiranog proteina? zasto?

    • da, jer se sekvence denaturacijom ne mjenjaju sto znaci da primarna struktura proteina ostaje

  45. sto je tocno o dermatosparksiji?

    • to je genetski prenosiva bolest stoke

    • uzrukovana je deficitom prokolagen peptidaze

    • N i C terminalna podrucja prekursorskih lanaca kolagena se ne odcjepljuju

  46. sto je tocno o hemoglobinu?

    • samo Fe2+ moze vezati kisik

    • sadrzi protoporfirin IX

    • osim hema, sadrzi i 4 polipeptidna lanca, 2 alfa i 2 beta lanca

    • u razlicitim tipovima hemoglobina, polipeptidni lanci se mogu rezlikovati

  47. kod vecine sisavca DPG modulira reverzibilno vezanje kisika na hemoglobin. kod odraslih ptica je to:

    • inozitol pentafosfat

  48. sto je tocno?

    • inhibicija kompetitivnih inhibitorom moze se smanjiti dodavanjem pravog supstrata

    • teski metali mogu ometati enzimske reakcije

  49. Km najbrzeg enzima

    • Km=10'-7 (tj najmanji)

  50. jedinice u koima se mjeri aktivnost enzima su

    • U/L (IU/L)

    • katal

  51. povezi tvrdnje

    • primarna - linearni reaspored AK

    • sekundarni - prostorni oblik AK

    • tercijalna - prostorni oblik AK i pobocnih lanaca

    • kvartalna - povezanje proteinskih podjedinica

  52. katabolizam hemoglobina:

    • bilirubin nastaje iz hema

    • globin se razraduje na aminokiseline

  53. uloga vitamina C:

    • sudjeluje kao reducens u brojim bioloskim procesima, vazan je za sintezu kolagena i karnitina te za metabolizam masnih kiselina. djeluje kao reducens koji odrzava Fe2+ u tome obliku, sprijecava oksidaciju u Fe3+. povecava otpornost organizma prema infekcijama.

    • nedostatak. krvarenje, tesko zarastanje rana, anemije

  54. sto je tocno?

    • naboj AK odreduje reaktivnost i svojstva AK

    • svi proteini se sastoje od 20 AK smo u razlicitim omjerima

    • AK su u proteinima povezane peptidnom vezom

    • sve AK kod zivotinja su u L formi

    • D aminokiseline mogu biti toksicne za organizam

  55. hidrolizom polipeptida koji se sastoji od 9 AK nastaje 8 MOLEKULA VODE

  56. objasni mehanizam trovanja dikumarolom (inhibitor vitamina K) uzevsi u obzir modifikacije AK u faktorima koagulacije:

    • Dikumarol je antagonist vitamina Kž. Ako se inhibira djelovanje vitamina K, ne dolazi do karboksilacije glutamanske kiseline te se na nju ne moze vezati Ca2+ te zato krv ne mloze koagulirati i dolazi do krvarenja