9_Paskaita_Transkripcija_eukariotai_2023

Eukariotų RNR Polimerazės

  • RNR polimerazės tipai:

    • RNR pol I: sintetina rRNR (18S, 5.8S, 28S)

    • RNR pol II: sintetina iRNR (mRNR), miRNR, snRNR

    • RNR pol III: sintetina tRNR, 5S rRNR, snRNR

    • RNR pol IV and V: sintetinama augalų genų transkriptai, dalyvaujantys RNA-directed DNA methylation procese.

RNR Polimerazės Funkcijos

  • Prokariotai vs. Eukariotai:

    • Prokariotai turi vieną RNR polimerazę

    • Eukariotai turi tris tipus RNR polimerazių (I, II, III)

    • Eukariotų transkripcija vyksta branduolyje, o prokariotų - citoplazmoje

Promotoriai ir Reguliaciniai Elementai

  • Promotorių tipai:

    • Artimieji promotoriai: veikia greitai prie genų

    • Tolimieji promotoriai: gali būti toli nuo genų ir kontroliuoti jų ekspresiją

  • Transkripcijos veiksniai:

    • Susideda iš didelio skaičiaus baltymų, kurie padeda atpažinti ir prisijungti prie promotorių, reikalingų transkripcijai.

RNR Polimerazės II PIC Kompleksas

  • PIC (Pre-Initiation Complex):

    • Įtraukiami įvairūs transkripcijos faktoriai (TFIID, TFIIA, TFIIB, TFIIF, TFIIE, TFIIH)

    • TFIID turi TBP (TATA-binding protein), kuris jungiasi prie TATA sekos iniciuojant transkripciją

RNR Polimerazė II Struktūra

  • Struktūriniai elementai:

    • Sudaryta iš subvienetų Rpb1 ir Rpb2

    • RNR polimerazės II atveju aktyviame centre yra du judrūs elementai: BH spiralė ir TL kilpa

Aukštesnis Organizavimas

  • Transkripcijos inicijavimo proceso etapai:

    • Promotorių elementai sąveikauja su transkripcijos faktoriais, įskaitant koaktyviklius ir slopiklius

    • Stiprikliai (enhancers) aktyvina transkripciją, o slopikliai (silencers) ją slopina

CTD Domenas

  • CTD (C-terminal domain) struktūra:

    • Svarbus RNR polimerazės II veikimui ir reguliavimui

    • Hiperfosforilintas - transkripcijos iniciacijos procesas.

Izoliatoriai

  • Izoliatorių funkcijos:

    • Atskiriant stipriklius nuo slopiklių, užtikrinant, kad tinkami genai būtų aktyvuojami.

Srities kontrolės elementai

  • Funkcija:

    • Organizuoja funkcinį chromatino domeną, aktyvindami gretimų genų transkripciją.