Laura cromatina final
Estructura del ADN y Empaquetamiento
El empaquetamiento del ADN se lleva a cabo a un nivel de complejidad notable, siendo hasta cuarenta veces más compacto que el ADN sin proteínas.
Existen dos tipos de arreglos para la fibra de nanómetros: solenoidal y zigzag.
Solenoidal: es un arreglo de inicio simple.
Zigzag: es un arreglo más complejo, de doble inicio, que requiere interacciones entre nucleosomas.
En este arreglo, el ADN de enlace queda orientado hacia el centro de la estructura.
Formación de Estructuras de Nucleosomas
El arreglo zigzag necesita más de un arreglo de diez nanómetros para formarse. Su estructura se genera a partir de nucleosomas que se apilan uno sobre otro.
La replicación del ADN implica utilizar octámeros preformados y histonas libres, que se integran secuencialmente para formar nuevos nucleosomas.
Las histonas son esenciales en la organización del ADN, donde chaperonas como K1 son reclutadas por PCNA, un factor de procesividad de ADN, facilitando la integración de histonas en las nuevas cadenas replicadas.
Vías de Ensamblaje de Nucleosomas
Existen dos vías para el ensamblaje de nucleosomas: una acoplada a la replicación y otra independiente.
Durante la horquilla de replicación, los octámeros son desplazados por ACF, que ayuda en la desensamblaje de histonas de cadenas parentales.
K1 también juega un papel crucial en transferir histonas recién sintetizadas a las cadenas nacientes, formando nueves nucleosomas con gran rapidez.
Posicionamiento de Nucleosomas y Secuencias de ADN
Los nucleosomas formados independientemente de la replicación siempre llevan la variante de H3.3, que no incluye la opción de integrar versiones anónicas.
A través de experimentos de cultivos celulares, es posible observar variabilidades en las bandas que indican las ubicaciones de secuencias específicas del ADN dentro de los nucleosomas.
La electroforesis revela bandas difusas, mostrando cómo los nucleosomas se depositan o excluyen de secuencias específicas del ADN.
Interacción del ADN y Nucleosomas
La presencia de un nucleosoma en una secuencia de ADN específica implica un posicionamiento constante, lo cual es vital para la regulación de la expresión genética.
En experimentos de doble digestión, los extremos del ADN de enlace son cortados, y solo se observa una banda correspondiente a extremos de nucleosomas, indicando que algunas secuencias pueden estar presentes en múltiples localizaciones.
Desplazamientos y Accesibilidad del ADN
Si el ADN se desplaza unos pares de bases, ciertas secuencias podrían liberarse hacia el ADN de enlace, quedando así más protegidas contra acción de nucleasas.
La rotación de las cadenas de ADN determinará qué secuencias quedan expuestas a nucleasas y factores, siendo más susceptibles aquellas expuestas en la superficie del octámero.
Conclusiones sobre la Regulación Génica
Algunas secuencias de ADN que inicialmente estaban expuestas pueden quedar protegidas al reacomodarse dentro de la partícula del nucleosoma.
Durante el corte de ADNa y el uso de enzimas de restricción, se marcan sitios relativos a distancias dentro de la misma secuencia, lo que afecta el posicionamiento y la transcripción.
Elementos como CSS son relevantes en la expresión génica, especialmente ante choques térmicos que pueden propagar efectos a genes adyacentes, induciendo la expresión de genes como HP setenta.