Annales Biochimie

Protéines globulaires

* ADN polymérase
* Myoglobuline
* Phosphatase alcaline

(enzyme, hormone et anticorps)

Constituants d’un glycolipide membranaire

* Un acide gras
* Un sucre D/ une partie saccharidique
* Un sphingosine

Quelles maladies résultent d’une maturation ?

* mucovicidose
* syndrome de marfan
* thalassémie

Produits que le foie peut synthétiser

* cholestérol
* acides gras
* glycogène

Toutes les protéines fibreuses

* sont solubles dans une solution hydrophobes
* possèdent un seul type de structure secondaires
* sont des protéines de support
* présente beaucoup d’acides aminés non polaires à sa surface

\

La transcription

* est unidirectionnelle
* se déroule dans le noyau
* implique des ARN polymérase

\

Inhibition imcompétitive d’une enzyme

* Vmax diminue
* inhibiteur se fixe à E quand S est fixé à E
* Km diminue
* plus il y a de substrat, plus il y a d’inhibition

Hémoglobine adulte

* forme déoxy est stabilisée par des ponts salins
* une diminution de 2,3 biphosphoglycérate augmente son affinité pour l’O2
* le 2,3 biphosphoglycérate se fixe sur des AA de l’Hba

Dans quel métabolisme intervient la pyruvate kinase ?

Glycolyse

Dans quel mécanisme intervient l’acétylcoA Carboxylase

Cycle de Krebs

Dans quel métabolisme intervient la lécithine cholesterol acyl transférase ?

Métabolisme des lipoprotéines

Cholestérol

→ il est un composant des membranes des cellules animales

→ il est synthétisé en période de nutrition

→ il est le précurseur de l’hormone calcitriol

Glycogène

→ représente une réserve glucidique

→ est synthétisé en période de nutrition

→ est une molécule hautement hydratée

Traduction

→ l’activité enzymatique peptidytransférase est portée par le ribosome

→ la translocation du ribosome nécessite une dépense énergétique

→ la synthèse protéique se fait de l’extrémité N-terminale vers l’extrémité C-terminal

Glycosylation

→ la N-glycosylation nécessite l’intervention d’un oligosaccharide pivot

→ la N-glycosylation est une modification co-traductionnelle

→ la glycosylation est parfois nécessaire à l’activité biologique d’une protéine

Une nouvelle hormone induit une augmentation de Ca²+ intracellulaire dans les cellules. Cochez les trois caractéristiques probables des récepteurs à cette hormone

* récepteurs transmembranaires
* récepteurs couplés à une protéine Gp
* récepteurs couplés à une activité phospholipase C

Quel sera l’effet d’un jogging de 10km, à raison de 2 fois par semaine pendant 3 mois, chez une femme ayant un régime alimentaire stable de 2200kcal/jour

* son poids initial va diminuer
* son indice de masse corporelle initial va diminuer

Que pouvez-vous dire d’un candidat médicament qui a pour effet d’inhiber de façon irréversible la F1/F0 ATPase humaine

* il inhibe la synthèse d’ATP
* il sera très dangereux pour la santé

Que provoque l’occupation du récepteur à l’insuline ?

* activation d’une tyrosine kinase
* activation de phosphatases
* activation de MAP kinase

Réactions de transamination

* participent à la synthèse et la dégradation des AA
* se déroulent en période de jeûne et en période de nutrition
* catalysent une réaction entre AA et un alpha-céto-acide

On engage 4 molécules d’ADN dans une réaction de PCR. Combien de molécules d’ADN obtiendra-t-on après 4 cycles?

64 : nbr de copie échantillon x 2^n

Dans quel métabolisme intervient l’ornithine transcarbamylase?

Cycle de l’urée (2ème étape du cycle)

Identifiez la molécule

Nucléotide

Quelles sont les propriétés communes des vitamines hydrosolubles et liposolubles?

* absorption au niveau de l’intestin
* doivent être fournies par l’alimentation
* ne fournissent pas d’énergie

Quelle réserves énergétiques seront mobilisées par l’organisme lors d’un jeûne de courte durée?

* triglycérides
* glycogène hépatique
* protéines musculaires

Qu’est ce qui caractérise un patient atteint de diabète de type 2?

* hyperglycémie
* résistance à l’insuline
* obésité
* défaut de translocation des Glut4

Quelles molécules peuvent servir de substrats à la glucogénogenèse

* alanine
* glycérol
* pyruvate

Quelles sont les réactions qui sont qualifiées de réactions générant un flux métabolique ?

* triglycéride lipase
* glycogène phosphorylase
* glucose 6 phosphate déshydrogénase

ADN

* les bases complémentaires se lient par liaisons hydrogènes
* les nucléotides se lient par des liaisons phosphodiesters
* les deux brins sont orientés de façon anti-parallèle

Contraction musculaire

* elle implique la troponine C qui fixe du calcium
* elle est causée par le raccourcissement simultané des sarcomères
* elle met en jeu une modification conformationnelle de la tropomyosine

Lipoprotéines HDL

* elles sont synthétisées par le foie
* elles sont les lipoprotéines qui contiennent le plus de protéines
* elles contiennent de l’ApoA1 qui active la lécithine cholestérol acyl transférase

Régulation de la phosphofructokinase 1

* inhibition allostérique par de fortes concentrations d’ATP
* inhibition allostérique par le citrate
* activation allostérique par le fructose 2,6 biphosphate

Quels mécanismes sont impliqués dans la synthèse d’ATP lors des phosphorylations oxydatives?

* un flux de protons provoque un changement conformationnel de F0/F1 ATP synthase
* la membrane externe de la mitochondrie est perméable
* les variations de potentiel d’oxydo-réduction sont utilisées pour synthétiser de l’ATP

Concernant les bilans énergétiques

* celui de l’utilisation du galactose est égal à celui de l’utilisation du fructose (=glucose aussi)
* celui des phosphorylations oxydatives à partir du NADH est supérieur à celui de la glycolyse anaérobie
* celui des phosphorylation oxydatives à partir de succinate est inférieur à celui de l’utilisation du galactose (mais = à celui de la glycolyse anaérobie)
* celui du cycle de Krebs est inférieur à celui de la bêta-oxydation des acides gras

Concernant le collagène

* c’est une protéine fibreuse
* sa structure est stabilisée par l’action de la lysyl oxydase
* sa synthèse requiert l’hydroxylation d’AA

Quel est le neurotransmetteur de la jonction neuromusculaire

Acétylcholine

Concernant l’insuline

* elle est libérée par les cellules béta pancréatique
* elle augmente le taux de Glut4 membranaire
* elle stimule la citrate lyase

Comment détermine-t-on le Km d’une enzyme monomérique

on détermine graphiquement le Km à l’aide d’une transformation de Lineweaver-Burke

Point de fusion des acide gras

acide gras polyinsaturé : -50°C à +10°C

acide gras monoinsaturés : +10°C à +20°C

acide gras saturés : +20°C à +

Quelles enzymes sont activées par l’insuline ?

* citrate lyase
* G6P deshydrogénase
* Citrate synthase

En ce qui concerne les protéines de la matrice extracellulaire

* le collagène confère des propriétés de résistance à la traction
* l’élastine est synthétisée par les fibroblastes
* les intégrines jouent un rôle dans l’adhésion cellulaire

A quoi est dû l’augmentation du taux de calcium intracellulaire en réponse à une hormone ?

* l’activation d’un récepteur extracellulaire
* l’activation d’une phospholipase C
* d’une augmentation en inositol 1,4,5 triphosphates

Classer par ordre croissant les bilans énergétiques (plus petit en haut)

* glycolyse anaérobie (2 ATP)
* phosphorylation oxydative du NADH (3 ATP)
* métabolisme du fructose (30 ATP)
* cycle de Krebs (38 ATP)
* bêta oxydation des acides gras (129 ATP)

Lors de la division cellulaire, la réplication de l’ADN est semi-conservative. Elle nécessite

l’action d’une ADN Polymérase

En période de nutrition

l’insuline active l’entrée de glucose dans le foie et le muscle

* l’inhibiteur C a une structure qui ne ressemble pas a celle de S
* l’inhibiteur B est un inhibiteur compétitif

La fixation de l’insuline à son récepteur induit l’activation de :

* phosphatase
* protéine MAP kinase
* Protéine tyrosine kinase

Le fructose est aussi un :

* hexose
* sucre D
* cétose

Quelles sont les voies métaboliques activées dans le foie à jeun ?

* cétogenèse
* glycogénolyse
* gluconéogenèse

Concernant l’hémoglobine

* sa contraction est augmentée par l’érythropoïétine
* contient 0,34% de fer
* taux normal chez l’homme entre 135 et 175 g/100ml
* taux normal chez la femme : 120 et 155 mg/100ml
* elle peut momentanément fixer du CO2 de façon covalente
* !!!!! attention aux unités données

Quelles sont les caractéristiques du diabète de type 2

* perturbation de la signalisation des récepteurs à insuline
* taux d’insuline plasmatique supérieur à la normale
* diminution de la captation via les GLUT4 (+ défaut de translocation des GLUT4)
* obésité
* hyperglycémie

Quelles sont les conséquences d’une diminution de la concentration en 2,3 DPG sur l’hémoglobine adulte

* augmentation de l’affinité de l’Hb pour l’O2
* favorisation de la formation d’oxy-Hb

Quels mécanismes sont impliquées dans la dénaturation des acides aminés ?

* réaction de transamination
* réactions de déamination oxydative
* réaction du cycle de l’urée

Cochez les 3 macro minéraux

* potassium
* sodium
* calcium
* magnésium

Quelles sont les bonnes affirmation pour phosphorylations oxydatives

* elles permettent l’oxydation du NADH
* la F0/F1 ATP synthase subit des modifications conformationnelles
* elles se déroulent dans la mitochondrie

Les chaperons moléculaires participent au reploiement d’une protéine

Les chaperons moléculaires assurent le repliement 3D des protéines en maturation et leur transport transmembranaire

Diabète

* type 1 = absence de production d’insuline
* type 2 = insensibilité à l’insuline

Laminine = protéine structurale ?

→ le collagène (protéine structurale) va interagir avec la laminine qui elle même va interagir avec l’intégrine

Apports journalier en protéine

* lipides = 30%
* glucide = 55%
* protéine = 15%

Les acides aminés lors de la cétogenèse sont dégradés en pyruvate

La cétogenèse permet la dégradation de corps cétoniques

Etapes de la synthèse de l’élastine

→ dans le RE = tropoelastine (précurseur)

→ hydroxylation de 1% des protéines mais pas de glycosylation et pas de peptides d’extension

→ prise en charge par chaperons, passe dans l’appareil de Golgie puis libéré par exocytose

→ dans milieu extracellulaire :

* association chaperons avec firbilline
* libération d’élastine
* polymérisation = association 4 par 4 des molécules en fibre frâce à la lysyloxydase

Lipoprotéine lipase nécessite ApoC2 comme cofacteur ?

Vrai

Division cellulaire ; ordre chronologique

→ interphase

→ prophase

→ prométaphase

→ métaphase

→ anaphase

→ télophase

Par quoi est synthétisé le collagène ?

Fibroblaste

Toutes GFM sont irréversible ?

→ réaction GFM = réaction irréversible, saturée en substrat qui impose une direction au flux et un flux constant à la voie métabolique

Carences :

* Vit A = cécité
* Vit B1 = Béribéri
* vit B2 = lésions cutanés/oculaires
* vit B3 = pellagre
* vit B5 = faiblesse musculaire
* vit B6 = signes cutanés muqueux
* vit B8 = douleur musculaire, dépression
* vit B9/B12/E = anémie
* vit C = scorbut
* vit D = rachitisme
* vit K = hémorragie

Triglycéride =

3 acides gras

Réaction GFM et triglycéride lipase

la réaction GFM est la lipolyse du tissu adipeux par la triglycéride lipase

La dopamine est un neurotransmetteur de quelles type de neurone ?

neurone excitateur

Le cholestérol

* fait partie de la famille des stéroïdes
* est synthétisé dans le cytosol des cellules du foie
* HMG CoA réductase limite la synthèse du cholestérol
* en période de jeûne : le glucagon inhibe ka synthèse du cholestérol en inhibant le HMG CoA réductase
* en période de nutrition : l’insuline active la synthèse de cholestérol en activant le HGM CoA réductase

Baisse du pH sur HB chez adulte

→ baisse de pH → modification de la conformation de l’HB → désoxy Hb → Hb cède O2 à Mb

Traduction

* initiation :
* fixation méthinyl-ARNt
* élongation :
* synthèse protéique de N vers C terminal
* traduction ARNm de 5’ vers 3’
* fixation de l’aminoacyl-ARNt
* formation liaison peptidique
* peptidyl transferase ribosomale

catalyse la formation de la liaison peptidique

* translocation : glissement du ribosome d’un codon sur l’ARNm
* fin traduction :
* codon stop sur site A
* hydrolyse de la liaison ester du peptydyl-ARNt

Hormone qui augmente le calcium intracellulaire

Acétylcholine : neurotransmetteur de la jonction musculaire

Structure tertiaire

= repliement de la chaine polypeptide dans l’espace

F1/F0 ATPase inhibé = augmentation ATP?

→ entraine la diminution d’ATP et augmente le flux d’électron

Transport actif

= passage d’un ion ou d’une molécule à travers une membrane contre son gradient de concentration → besoin d’énergie

Protéine globulaire

→ protéines régulatrices en enzymes

→ structures = multiples, repliés sous formes globulaires

→ solubles en milieu aqueux

ADN

→ acide désoxyribonucléique

→ complémentaire des bases AT et CG

L’insuline inhibe

* malonyl CoA

Insuline inactive les enzyme :

* fructose biphosphatase
* glycogène phosphorylase
* triglycéride lipase

Insuline active

VLDL (constitué à 10% de protéines)

L’Apo C2 est surtout présente

Dans les VLDL et chylomicrons

Microfibrille = ?

Fibriline + élastine

Lors de la division cellulaire, la réplication de l’ADN est et à besoin de ?

* est semi conservative
* nécessite l’action d’une hélicase
* primase
* ADN polymérase III
* ADN polymérase I
* ARNase H
* ADN ligase

Inhibition compétitive

* Vmax ne change pas
* Km change
* inhibiteur se fixe que à E et ressemble à S
* l’action de l’inhibiteur compétitif sera plus forte à faible concentration de S

Inhibition non compétitif

* Vmax diminue
* Km ne change pas
* inhibiteur se fixe indépendamment à E ou ES
* concentration en substrat n’influence pas son action

Molécule qui peuvent servir de substrats à la gluconéogenèse

* alanine
* pyruvate
* glycérol

Caractéristique du diabète de type I

* destruction des cellules bête pancréatique
* traitement par injection d’insuline
* dénaturation de l’insuline

Conséquence d’une augmentation de la concentration en 2,3 DPG sur l’Hb adulte

* diminue affinité de l’Hb pour O2
* augmente affinité Mb pour O2
* modification de la conformation de l’Hb

Microminéraux

* fer
* cobalt
* silicium
* cuivre

Structure secondaire

* dépende de la primaire
* stabilisée par liaisons hydrogène

Structure tertiaire

* dépend de la primaire
* stabilisée par liaisons H
* liaisons hydrophobes
* ponts disulfures
* liaison ionique

Protéines fibreuse exemple

* alpha kératines
* beta kératines
* fibrillines
* hélastine

Transamination implique

* transfert entre un acide aminé et un céto-acide

ADN

Pentose double hélice droite

ARNt

se fixe avant les ribosomes

Voies métaboliques dans lesquelles interviennent les enzymes suivantes :

* ornithine transcarbamylase : cycle de l’urée
* citrate synthase : cycle de krebs
* glycolyse : SGLT puis PFK1
* phosphatase : partout

Cause des pathologie

* Thalassémie : HbS
* Anémie falciforme : Hb
* syndrome de marfan : firbilline
* syndrome de menkens : collagène

une voie métabolique se déroule toujours dans un tissu ?

Faux